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dc.contributor.author
Barbini, Luciana Fernanda
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dc.contributor.author
Elizalde, Maria Mercedes
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dc.contributor.author
Torres, Carolina
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dc.contributor.author
Campos, Rodolfo Hector
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dc.date.available
2015-08-31T13:37:09Z
dc.date.issued
2013-07
dc.identifier.citation
Barbini, Luciana Fernanda; Elizalde, Maria Mercedes; Torres, Carolina; Campos, Rodolfo Hector; Molecular epidemiology and genetic diversity of hepatitis B virus in Mar del Plata city, Argentina; Elsevier; Infection, Genetics and Evolution; 19; 7-2013; 152-163
dc.identifier.issn
1567-1348
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/1882
dc.description.abstract
The aim of this work was to describe the current molecular epidemiology and genetic diversity of HBV in Mar del Plata, an important Argentinean touristic city. The phylogenetic analysis of 29 HBV DNA positive serum samples showed that F1b was the predominant subgenotype (sgt, 62.1%), followed by sgt A2 (13.8%) and sgt F4, gt D and gt G (6.9% each). Among anti-HBc IgM positive samples, 75.0% were sgt F1b, followed by sgt F4 (12.5%), sgt A2 (6.25%) and sgt D (6.25%). Three recombinant full length genomes were found: two G/F1b (some of the first gt G detected in Argentina) and one F4/D2. The circulation of clinical important mutations in the city was described. Mutations at the HBsAg were detected in 34.5% of the analyzed samples, associated with laboratory diagnosis and antiviral treatment failures, immune escape and hepatocellular carcinoma. Most of the samples presented wild type BCP/PC sequences. Coalescence analysis for the most prevalent sgt F1b estimated that the diversification mainly occured during mid ?90s and the tMRCA was estimated in 1987. Finally, the high presence of the autochthonous sgt F1b, associated with the anti-HBc IgM positive infection and its present-day diversification process, shows the strong impact of internal human migratory movements into the current population of Mar del Plata.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Hepatitis B Virus
dc.subject
Epidemiology
dc.subject
Diversity
dc.subject
Mar del Plata
dc.subject.classification
Epidemiología
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dc.subject.classification
Ciencias de la Salud
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dc.subject.classification
CIENCIAS MÉDICAS Y DE LA SALUD
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dc.title
Molecular epidemiology and genetic diversity of hepatitis B virus in Mar del Plata city, Argentina
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2016-03-30 10:35:44.97925-03
dc.journal.volume
19
dc.journal.pagination
152-163
dc.journal.pais
Países Bajos
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dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Barbini, Luciana Fernanda. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina
dc.description.fil
Fil: Elizalde, Maria Mercedes. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina
dc.description.fil
Fil: Torres, Carolina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina
dc.description.fil
Fil: Campos, Rodolfo Hector. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina
dc.journal.title
Infection, Genetics and Evolution
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1567134813002724
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2013.07.007
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