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dc.contributor.author
David, Aldana Paula
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dc.contributor.author
Pipier, Angélique
dc.contributor.author
Pascutti, Federico
dc.contributor.author
Binolfi, Andrés
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dc.contributor.author
Weiner, Andrea Maria Julia
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dc.contributor.author
Challier, Emilse
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dc.contributor.author
Heckel, Sofía Belén
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dc.contributor.author
Calsou, Patrick
dc.contributor.author
Gomez, Dennis
dc.contributor.author
Calcaterra, Nora Beatriz
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dc.contributor.author
Armas, Pablo
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dc.date.available
2023-01-27T16:24:29Z
dc.date.issued
2019-06
dc.identifier.citation
David, Aldana Paula; Pipier, Angélique; Pascutti, Federico; Binolfi, Andrés; Weiner, Andrea Maria Julia; et al.; CNBP controls transcription by unfolding DNA G-quadruplex structures; Oxford University Press; Nucleic Acids Research; 47; 15; 6-2019; 7901-7913
dc.identifier.issn
0305-1048
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/185969
dc.description.abstract
Guanine-rich DNA strands can fold into non-canonical four-stranded secondary structures named G-quadruplexes (G4). Experimental evidences suggest that G4-DNA surrounding transcription start sites act as cis-regulatory elements by either stimulating or inhibiting gene transcription. Therefore, proteins able to target and regulate specific G4 formation/unfolding are crucial for G4-mediated transcriptional control. Here we present data revealing that CNBP acts in vitro as a G4-unfolding protein over a tetramolecular G4 formed by the TG4T oligonucleotide, as well as over the G4 folded in the promoters of several oncogenes. CNBP depletion in cellulo led to a reduction in the transcription of endogenous KRAS, suggesting a regulatory role of CNBP in relieving the transcriptional abrogation due to G4 formation. CNBP activity was also assayed over the evolutionary conserved G4 enhancing the transcription of NOGGIN (NOG) developmental gene. CNBP unfolded in vitro NOG G4 and experiments performed in cellulo and in vivo in developing zebrafish showed a repressive role of CNBP on the transcription of this gene by G4 unwinding. Our results shed light on the mechanisms underlying CNBP way of action, as well as reinforce the notion about the existence and function of G4s in whole living organisms.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Oxford University Press
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
G-QUADRUPLEX
dc.subject
TRANSCRIPTION
dc.subject
ONCOGENES
dc.subject
NOGGIN
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
CNBP controls transcription by unfolding DNA G-quadruplex structures
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2020-11-25T17:56:26Z
dc.identifier.eissn
1362-4962
dc.journal.volume
47
dc.journal.number
15
dc.journal.pagination
7901-7913
dc.journal.pais
Reino Unido
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dc.journal.ciudad
Oxford
dc.description.fil
Fil: David, Aldana Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Pipier, Angélique. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia. Université Fédérale Toulouse; Francia
dc.description.fil
Fil: Pascutti, Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Binolfi, Andrés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Weiner, Andrea Maria Julia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Challier, Emilse. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
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Fil: Heckel, Sofía Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Calsou, Patrick. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia. Université Fédérale Toulouse; Francia
dc.description.fil
Fil: Gomez, Dennis. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia. Université Fédérale Toulouse; Francia
dc.description.fil
Fil: Calcaterra, Nora Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Armas, Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.journal.title
Nucleic Acids Research
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkz527/5521029
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1093/nar/gkz527
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