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dc.contributor.author
Zeida Camacho, Ari Fernando
dc.contributor.author
Reyes, Aníbal M.
dc.contributor.author
Lichtig, Pablo
dc.contributor.author
Hugo, Martín
dc.contributor.author
Vazquez, Diego Sebastian
dc.contributor.author
Santos, Javier
dc.contributor.author
Gonzalez Flecha, Francisco Luis
dc.contributor.author
Radi, Rafael
dc.contributor.author
Estrin, Dario Ariel
dc.contributor.author
Trujillo, Madia
dc.date.available
2017-06-16T21:07:15Z
dc.date.issued
2015-12
dc.identifier.citation
Zeida Camacho, Ari Fernando; Reyes, Aníbal M.; Lichtig, Pablo; Hugo, Martín; Vazquez, Diego Sebastian; et al.; Molecular basis of hydroperoxide specificity in peroxiredoxins: the case of AhpE from Mycobacterium tuberculosis; American Chemical Society; Biochemistry; 54; 49; 12-2015; 7237-7247
dc.identifier.issn
0006-2960
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/18370
dc.description.abstract
Peroxiredoxins (Prxs) constitute a ubiquitous family of Cys-dependent peroxidases that play essential roles in reducing hydrogen peroxide, peroxynitrite and organic hydroperoxides in almost all organisms. Members of the Prx subfamilies show differential oxidizing substrate specificities that await explanations at a molecular level. Among them, alkyl hydroperoxide reductases E (AhpE) is a novel subfamily comprising Mycobacterium tuberculosis AhpE and AhpE-like proteins expressed in some bacteria and archaea. We previously reported that <i>Mt</i>AhpE reacts ~10<sup>4</sup> times faster with an arachidonic acid-derived hydroperoxide than with hydrogen peroxide, and suggested that this surprisingly high reactivity was related to the presence of a hydrophobic groove at the dimer interface evidenced in the crystallography structure of the enzyme. In this contribution we experimentally confirmed the existence of an exposed hydrophobic patch in <i>Mt</i>AhpE. We found that fatty acid hydroperoxide reduction by the enzyme showed positive activation entropy that importantly contributed to catalysis. Computational dynamics indicated that interactions of fatty acid-derived hydroperoxides with the enzyme properly accommodated them inside the active site favoring the anchorage of the enzyme in a reactive conformation. The computed reaction free energy profile obtained via QM/MM simulations is consistent with a greater reactivity in comparison with hydrogen peroxide. This study represents new insights on the understanding of the molecular basis that determines oxidizing substrate selectivity in the Prx family, which has not been investigated at an atomic level so far.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
American Chemical Society
dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Peroxiredoxins
dc.subject
Peroxides
dc.subject
Substrate Specificity
dc.subject
Activation Parameters
dc.subject
Transition State
dc.subject.classification
Biofísica
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
Molecular basis of hydroperoxide specificity in peroxiredoxins: the case of AhpE from Mycobacterium tuberculosis
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2017-06-15T17:36:28Z
dc.journal.volume
54
dc.journal.number
49
dc.journal.pagination
7237-7247
dc.journal.pais
Estados Unidos
dc.journal.ciudad
Washington D. C.
dc.description.fil
Fil: Zeida Camacho, Ari Fernando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Inorgánica, Analítica y Química Física; Argentina
dc.description.fil
Fil: Reyes, Aníbal M.. Universidad de la República; Uruguay
dc.description.fil
Fil: Lichtig, Pablo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Inorgánica, Analítica y Química Física; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; Argentina
dc.description.fil
Fil: Hugo, Martín. Universidad de la República; Uruguay
dc.description.fil
Fil: Vazquez, Diego Sebastian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas "Prof. Alejandro C. Paladini". Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Santos, Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas "Prof. Alejandro C. Paladini". Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Gonzalez Flecha, Francisco Luis. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas "Prof. Alejandro C. Paladini". Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Radi, Rafael. Universidad de la República; Uruguay
dc.description.fil
Fil: Estrin, Dario Ariel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Inorgánica, Analítica y Química Física; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; Argentina
dc.description.fil
Fil: Trujillo, Madia. Universidad de la República; Uruguay
dc.journal.title
Biochemistry
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/ark/http://dx.doi.org/10.1021/acs.biochem.5b00758


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