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dc.contributor.author
Hurtado, Juan Pablo
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dc.contributor.author
Cunha Almeida, Francisca
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dc.contributor.author
Revale, Santiago
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dc.contributor.author
Hasson, Esteban Ruben
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dc.date.available
2022-12-28T14:31:05Z
dc.date.issued
2019-08
dc.identifier.citation
Hurtado, Juan Pablo; Cunha Almeida, Francisca; Revale, Santiago; Hasson, Esteban Ruben; Revised phylogenetic relationships within the Drosophila buzzatii species cluster (Diptera: Drosophilidae: Drosophila repleta group) using genomic data; Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung; Arthropod systematics & phylogeny; 77; 2; 8-2019; 239-250
dc.identifier.issn
1863-7221
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/182708
dc.description.abstract
The Drosophila buzzatii cluster is a South American clade that encompasses seven closely related cactophilic species and constitutes a valuable model system for evolutionary research. Though the monophyly of the cluster is strongly supported by molecular, cytological and morphological evidence, phylogenetic relationships within it are still controversial. The phylogeny of the D. buzzatii cluster has been addressed using limited sets of molecular markers, namely a few nuclear and mitochondrial genes, and the sharing of fxed chromosomal inversions. However, analyses based on these data revealed inconsistencies across markers and resulted in poorly resolved basal branches. Here, we revise the phylogeny of the D. buzzatii cluster based on a large transcriptomic dataset of 813 kb obtained from four members of this cluster: D. antonietae, D. borborema, D. buzzatii and D. koepferae, using the close relative D. mojavensis (also a member of the repleta group) as outgroup. Our phylogenomic analyses confrm that D. buzzatii is sister to the other six members of the cluster and, though incomplete lineage sorting likely obstructs phylogenetic resolution among these six species, allowed us to recover a novel topology. Divergence time estimates date the radiation of the cluster to the recent upper Pleistocene with most speciation events compressed to the last 500,000 years.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Cactophilic Drosophila
dc.subject
Transcriptome assembling
dc.subject
Phylogenimics
dc.subject
Divergence time
dc.subject.classification
Biología
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Revised phylogenetic relationships within the Drosophila buzzatii species cluster (Diptera: Drosophilidae: Drosophila repleta group) using genomic data
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2020-11-20T14:47:28Z
dc.identifier.eissn
1864-8312
dc.journal.volume
77
dc.journal.number
2
dc.journal.pagination
239-250
dc.journal.pais
Alemania
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dc.journal.ciudad
Dresden
dc.description.fil
Fil: Hurtado, Juan Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina
dc.description.fil
Fil: Cunha Almeida, Francisca. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina
dc.description.fil
Fil: Revale, Santiago. University of Oxford; Reino Unido
dc.description.fil
Fil: Hasson, Esteban Ruben. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina
dc.journal.title
Arthropod systematics & phylogeny
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.zobodat.at/pdf/Arthropod-Systematics-Phylogeny_77_0239-0250.pdf
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