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dc.contributor.author
Macchi, Marianela
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dc.contributor.author
Festa, Sabrina
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dc.contributor.author
Nieto, Esteban Emanuel
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dc.contributor.author
Irazoqui, José Matías
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dc.contributor.author
Vega Vela, Nelson E.
dc.contributor.author
Junca, Howard
dc.contributor.author
Valacco, Maria Pia
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dc.contributor.author
Amadio, Ariel Fernando
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dc.contributor.author
Morelli, Irma Susana
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dc.contributor.author
Coppotelli, Bibiana Marina
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dc.date.available
2022-10-18T01:41:46Z
dc.date.issued
2021-03
dc.identifier.citation
Macchi, Marianela; Festa, Sabrina; Nieto, Esteban Emanuel; Irazoqui, José Matías; Vega Vela, Nelson E.; et al.; Design and evaluation of synthetic bacterial consortia for optimized phenanthrene degradation through the integration of genomics and shotgun proteomics; Elsevier; Biotechnology Reports; 29; e00588; 3-2021; 1-15
dc.identifier.issn
2215-017X
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/173641
dc.description.abstract
Two synthetic bacterial consortia (SC) composed of bacterial strains Sphingobium sp. (AM), Klebsiella aerogenes (B), Pseudomonas sp. (Bc-h and T), Burkholderia sp. (Bk) and Inquilinus limosus (Inq) isolated from a natural phenanthrene (PHN)-degrading consortium (CON) were developed and evaluated as an alternative approach to PHN biodegradation in bioremediation processes. A metabolic network showing the potential role of strains was reconstructed by in silico study of the six genomes and classification of dioxygenase enzymes using RHObase and AromaDeg databases. Network analysis suggested that AM and Bk were responsible for PHN initial attack, while Inq, B, T and Bc-h would degrade PHN metabolites. The predicted roles were further confirmed by physiological, RT-qPCR and metaproteomic assays. SC-1 with AM as the sole PHN degrader was the most efficient. The ecological roles inferred in this study can be applied to optimize the design of bacterial consortia and tackle the biodegradation of complex environmental pollutants.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Synthetic bacterial consortia (SC)
dc.subject
Whole genome sequencing
dc.subject
Metabolic network
dc.subject
RT-qPCR
dc.subject
Shotgun proteomics
dc.subject
Polycyclic aromatic hydrocarbon (PAH)
dc.subject.classification
Biología Celular, Microbiología
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Design and evaluation of synthetic bacterial consortia for optimized phenanthrene degradation through the integration of genomics and shotgun proteomics
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2022-09-22T00:24:58Z
dc.journal.volume
29
dc.journal.number
e00588
dc.journal.pagination
1-15
dc.journal.pais
Países Bajos
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dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Macchi, Marianela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Festa, Sabrina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Nieto, Esteban Emanuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Irazoqui, José Matías. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Santa Fe. Estación Experimental Agropecuaria Rafaela; Argentina
dc.description.fil
Fil: Vega Vela, Nelson E.. Pontificia Universidad Javeriana; Colombia
dc.description.fil
Fil: Junca, Howard. Ecogenomics And Holobionts; Colombia
dc.description.fil
Fil: Valacco, Maria Pia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Amadio, Ariel Fernando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Santa Fe. Estación Experimental Agropecuaria Rafaela; Argentina
dc.description.fil
Fil: Morelli, Irma Susana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Coppotelli, Bibiana Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentina
dc.journal.title
Biotechnology Reports
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://reader.elsevier.com/reader/sd/pii/S2215017X21000047?token=4F8802D43222AC91A918EF0A14E74EB3C60B5F687345C1968F22AED467D3E511FEB71A9CD2A813CC26FF2C4B88B2DA4A
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.btre.2021.e00588
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