Mostrar el registro sencillo del ítem
dc.contributor.author
Simonetti, Ester
dc.contributor.author
Alvarez, Florencia
dc.contributor.author
Feldman, Nicolás
dc.contributor.author
Vinacour, Matias Esteban
dc.contributor.author
Roberts, Irma
dc.contributor.author
Ruiz, Jimena
dc.date.available
2022-09-26T10:04:18Z
dc.date.issued
2021-04
dc.identifier.citation
Simonetti, Ester; Alvarez, Florencia; Feldman, Nicolás; Vinacour, Matias Esteban; Roberts, Irma; et al.; Genomic insights into the potent antifungal activity of B. ambifaria T16; Academic Press Inc Elsevier Science; Biological Control; 155; 4-2021; 1-12
dc.identifier.issn
1049-9644
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/170318
dc.description.abstract
Burkholderia ambifaria T16 is a bacterial strain isolated from the rhizosphere of barley plants, which showed a potent antifungal activity against several Fusarium species. In this work, the construction of a mini-Tn5 insertional library in this strain allowed us the identification of several genes involved in the antifungal activity. In particular, several mutants with mini-Tn5 insertions located in a biosynthetic gene cluster (BGC) involved in the production of cyclic glycolipopeptides known as occidiofungins (Ocfs) were completely unable to inhibit the in vitro growth of F. oxysporum. Tandem mass spectrometry analysis of lipopeptide extracts obtained from culture supernatants of the wild-type strain allowed the identification of eight Ocfs structural variants, that were not detected in extracts of the mutants with insertions in the ocf gene cluster. These results indicate that the antifungal activity of B. ambifaria T16 mainly relies on Ocfs production. Moreover, an insertion in a BGC predicted to be involved in the biosynthesis of a membrane-associated lipopeptide designated AFC-BC11 reduced the antifungal activity of B. ambifaria T16 by approximately 50%. Accordingly, membrane extracts from the insertional mutant in the afc-BC11 cluster showed a marked reduction in the antifungal activity against several fungi. In contrast, the antifungal activity of the membrane fraction of mutants unable to produce Ocfs was not affected. Furthermore, a detailed bioinformatic analysis of the proteins encoded by the ocf and afc-BC11 gene clusters revealed that the biosynthesis of these lipopeptides would be initiated by fatty acyl-AMP ligase (FAAL) domain containing enzymes and continued by a hybrid non-ribosomal peptide synthetase (NRPS)/polyketide synthase (PKS) or a type III PKS, respectively. These results provide new insights into lipopeptide biosynthesis, which may be valuable in the field of novel antifungal compound design.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Academic Press Inc Elsevier Science
dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
BIOSYNTHETIC CLUSTERS
dc.subject
BURKHOLDERIA AMBIFARIA
dc.subject
FUSARIUM
dc.subject
LIPOPEPTIDES
dc.subject
OCCIDIOFUNGINS
dc.subject.classification
Biología Celular, Microbiología
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
Genomic insights into the potent antifungal activity of B. ambifaria T16
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2021-09-07T15:14:46Z
dc.journal.volume
155
dc.journal.pagination
1-12
dc.journal.pais
Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Simonetti, Ester. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Alvarez, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Feldman, Nicolás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Vinacour, Matias Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Roberts, Irma. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ruiz, Jimena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales; Argentina
dc.journal.title
Biological Control
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S104996442030757X
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.biocontrol.2020.104530
Archivos asociados