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dc.contributor.author
González Buitrón, Martín
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dc.contributor.author
Romario Tunque Cahui, Ronaldo
dc.contributor.author
García Ríos, Emilio
dc.contributor.author
Hirsh, Layla
dc.contributor.author
Fornasari, Maria Silvina
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dc.contributor.author
Parisi, Gustavo Daniel
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dc.contributor.author
Palopoli, Nicolás
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dc.date.available
2022-09-22T13:37:39Z
dc.date.issued
2020-10
dc.identifier.citation
González Buitrón, Martín; Romario Tunque Cahui, Ronaldo; García Ríos, Emilio; Hirsh, Layla ; Fornasari, Maria Silvina; et al.; CoDNaS-RNA: a database of Conformational Diversity in the Native State of RNA; Cold Spring Harbor Laboratory; bioRxiv; 10-2020; 1-5
dc.identifier.issn
0362-4331
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/169952
dc.description.abstract
Conformational changes in RNA native ensembles are central to fulfill many of their biological roles. Systematic knowledge of the extent and possible modulators of this conformational diversity is desirable to better understand the relationship between RNA dynamics and function.We have developed CoDNaS-RNA as the first database of conformational diversity in RNA molecules. Known RNA structures are retrieved and clustered to identify alternative conformers of each molecule. Pairwise structural comparisons within each cluster allows to measure the variability of the molecule. Additional data on structural features, molecular interactions and functional annotations are provided. CoDNaS-RNA is implemented as a public resource that can be of much interest for computational and bench scientists alike.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Cold Spring Harbor Laboratory
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
RNA
dc.subject
DATABASE
dc.subject
CONFORMATIONAL DIVERSITY
dc.subject.classification
Ciencias de la Información y Bioinformática
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dc.subject.classification
Ciencias de la Computación e Información
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
CoDNaS-RNA: a database of Conformational Diversity in the Native State of RNA
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2022-09-15T14:54:41Z
dc.journal.pagination
1-5
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.description.fil
Fil: González Buitrón, Martín. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Romario Tunque Cahui, Ronaldo. Pontificia Universidad Católica de Perú; Perú
dc.description.fil
Fil: García Ríos, Emilio. Pontificia Universidad Católica de Perú; Perú
dc.description.fil
Fil: Hirsh, Layla. Pontificia Universidad Católica de Perú; Perú
dc.description.fil
Fil: Fornasari, Maria Silvina. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Parisi, Gustavo Daniel. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Palopoli, Nicolás. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.journal.title
bioRxiv
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.10.30.362590v1.full
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1101/2020.10.30.362590
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