Estudio de la evolución del virus de la inmunodeficiencia humana (HIV) en hombres que tienen sexo con hombres en Argentina (2000-2013)

Abstract

Argentina es un país caracterizado epidemiológicamente por presentar una prevalencia de infección por HIV-1 dentro de la población de HSH sustancialmente elevada (12-15%). Si bien, estudios realizados han asociado a esta población a una alta prevalencia del subtipo B, la caracterización genómica del HIV-1 a lo largo de los años ha sido realizada principalmente mediante inferencia filogenética y mayormente sobre regiones subgenómicas tales como el gen pol. Éstas últimas dos consideraciones podrían acarrear una subestimación tanto en la frecuencia como en la diversidad de las formas recombinantes. Es por ello que como primer objetivo de este trabajo se propuso estudiar la evolución molecular y la filodinamia del virus del HIV-1 en HSH, actualizando las herramientas de análisis y optimizando la población bajo estudio. Para ello se analizaron retrospectivamente 312 secuencias correspondientes a un fragmento del gen pol y 25 secuencias casi completas (NFL) del HIV-1 obtenidas desde HSH de Argentina. De este análisis se ofrece clara evidencia de un creciente impacto de las formas recombinantes BF entre los HSH, quienes constituyen en el país un grupo activo que demanda una intervención clara que logre limitar la transmisión del virus. Por otra parte, se estudió el dinamismo evolutivo de los subtipos y formas recombinantes virales en HSH empleando análisis longitudinales, persiguiendo con ello conocer su evolución molecular y, desde allí, sustentar las probables asimetrías en su prevalencia. Para alcanzarlo se empleó un estudio longitudinal de las cuasiespecies del HIV entre HSH, desde etapas tempranas de la infección (PHI, Primary HIV Infection) hasta la cronicidad. Con el afán de una mayor rigurosidad en la caracterización viral, se recurrió al empleo de la técnica de secuenciación de nueva generación o NGS. Esta herramienta ofreció un caudal de magnífico tamaño para la definición de las cuasiespecies virales en cada hospedador y cada tiempo de análisis, permitiendo estimar la presencia de poblaciones minoritarias que aportan una contribución relativa del orden del 1%. Con esta información fue factible evaluar la presencia de mutaciones asociadas a resistencia, la dinámica del mosaicismo genético en las secuencias recombinantes, y la variabilidad viral durante el transcurso de la infección. Los resultados obtenidos de este análisis, permitieron vislumbrar a la recombinación como una fuente generadora de diversidad, así como también como una herramienta valiosa que le permite al virus incrementar su fitness merced a optimizar la adaptación de las variantes recombinantes. En conjunto, este trabajo de tesis constituye un aporte original sobre la dinámica y caracterización de las variantes virales que circulan entre HSH en Argentina.