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dc.contributor.author
Teich, Ingrid
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dc.contributor.author
Mottura, M.
dc.contributor.author
Verga, Aníbal Ramón
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dc.contributor.author
Balzarini, Monica Graciela
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dc.date.available
2022-07-01T16:20:54Z
dc.date.issued
2015-11
dc.identifier.citation
Teich, Ingrid; Mottura, M.; Verga, Aníbal Ramón; Balzarini, Monica Graciela; Association between genetic and phenotypic variability with adjustment for spatial autocorrelation in Prosopis; Sociedad Argentina de Genética; Basic and Applied Genetics; 26; 2; 11-2015; 63-74
dc.identifier.issn
1666-0390
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/161076
dc.description.abstract
Los estudios de asociación entre datos genéticos y fenotípicos permiten detectar interacciones relevantes. En estos análisis es necesario considerar los efectos de la estructura espacial de los datos, la cual es muy común en la naturaleza, particularmente en plantas. Prosopis chilensis y P. flexuosa son dos especies arbóreas de importancia económica y ambiental entre las cuales se produce flujo génico y se originan híbridos fértiles. Para la clasificación de estas especies se utilizan caracteres morfológicos, siendo de interés conocer y cuantificar la asociación entre la variabilidad fenotípica caracterizada mediante las variables usadas en la clasificación taxonómica, y la variabilidad genética. En este trabajo se exploran asociaciones multivariadas entre la variabilidad genética y morfológica de un enjambre híbrido entre P. chilensis y P. flexuosa, considerando la posible autocorrelación espacial en los datos. Para esto se utilizó la caracterización genética (seis marcadores microsatélites) y morfológica (13 caracteres) en 81 individuos adultos ubicados en una parcela de 4.700 m2 en Córdoba, Argentina. Se analizó la estructura espacial de la variabilidad genética y morfológica a escala fina y se asociaron ambas caracterizaciones mediante una aproximación de Mantel basada en la correlación de matrices de distancias y nuevas aproximaciones que incluyen el uso complementario de análisis multivariados y modelos lineales mixtos. Se encontró significativa asociación genotipo-fenotipo, información relevante para el ordenamiento del recurso genético algarrobo. Aún con la débil estructura espacial en los datos, la incorporación de la autocorrelación espacial mejoró la capacidad de detección y modelación de la asociación entre la variabilidad genética y fenotípica observada en el enjambre híbrido.
dc.description.abstract
Association studies that relate phenotypic and genetic information allow the detection of relevant interactions. In these studies it is necessary to consider the effects of spatial structure in the data, which is very common in nature, particularly in plant species. Prosopis chilensis and P. flexuosa are two hardwood arboreal species with environmental and economic importance. Significant gene flow occurs between them with the production of natural and fertile hybrids. Given that morphological characters are used to classify individual trees, it is of interest to explore the association between the phenotypic variables used in the taxonomic classification and genetic variability. In this work, multivariate associations between genetic and morphological variability were explored in a P. chilensis and P. flexuosa hybrid swarm considering the possible spatial autocorrelation. For this purpose the molecular (six polymorphic microsatellite markers) and the morphological (13 traits) characterizations of 81 adult trees in a 4,700 m2 plot in Córdoba, Argentina were used. The spatial structures of genetic and phenotypic variability were analyzed at a fine spatial scale. Both characterizations were associated through a Mantel approach based on the correlation of distance matrixes, as well as with new approaches that include the complementary use of multivariate analysis and mixed linear models. A significant genotype-phenotype association, relevant for the management of Prosopis genetic resources was detected. Even with a weak spatial structure, the inclusion of the spatial autocorrelation in the analyses improved the detection and modeling of the association between the observed genetic and phenotypic variability.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
spa
dc.publisher
Sociedad Argentina de Genética
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/ar/
dc.subject
ESTADÍSTICA ESPACIAL
dc.subject
ÍNDICE DE MORAN
dc.subject
CORRELACIÓN PARCIAL DE MANTEL
dc.subject
ANÁLISIS DE CORRELACIONES CANÓNICAS
dc.subject
ANÁLISIS DE PROCRUSTES GENERALIZADO
dc.subject.classification
Genética y Herencia
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Association between genetic and phenotypic variability with adjustment for spatial autocorrelation in Prosopis
dc.title
Asociación entre variabilidad genética y fenotípica con ajuste por autocorrelación espacial en Prosopis
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2022-06-21T18:36:06Z
dc.identifier.eissn
1852-6233
dc.journal.volume
26
dc.journal.number
2
dc.journal.pagination
63-74
dc.journal.pais
Argentina
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dc.journal.ciudad
Buenos Aires
dc.description.fil
Fil: Teich, Ingrid. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Desarrollo Rural. Area de Estadística y Biometría; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina
dc.description.fil
Fil: Mottura, M.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Verga, Aníbal Ramón. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Balzarini, Monica Graciela. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Desarrollo Rural. Area de Estadística y Biometría; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina
dc.journal.title
Basic and Applied Genetics
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332015000300006
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