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dc.contributor.author
Enrique, R
dc.contributor.author
Kurth, Daniel German
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dc.contributor.author
Ibarra Laclette, E
dc.contributor.author
Noguera, A
dc.contributor.author
Welin, Björn
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dc.contributor.author
Castagnaro, Atilio Pedro
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dc.date.available
2022-05-26T15:45:30Z
dc.date.issued
2021-09
dc.identifier.citation
Enrique, R; Kurth, Daniel German; Ibarra Laclette, E; Noguera, A; Welin, Björn; et al.; Identification of transgene flanking sequences in a pre-market safety assessed sugarcane in Argentina; Brazilian Soc Plant Breeding; Crop Breeding And Applied Biotechnology; 21; 3; 9-2021; 1-8
dc.identifier.issn
1984-7033
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/158240
dc.description.abstract
A prerequisite for commercial release of a transgenic crop variety inArgentina and other countries in the world is the identification and sequenceanalysis of the transgene(s) insertion site in the plant genome. Southern blotanalysis showed a high number of transgene inserts in the glyphosate-resistanttransgenic sugarcane line TUC 87-3RG. By using a targeted sequence enrichment approach, coupled with second-generation sequencing (SGS) and bioinformatic analyses, we were able to identify and subsequently analyze all flanking sequences for these transgene insertions in the sugarcane genome. PCR reactions confirmed 18 out of 29 candidate contigs as junction sequences that did not match essential genes in published sugarcane genomes. The methodology outlined here represents an efficient strategy for characterization of flanking sequences corresponding to multiple inserts of a transgene in a large, complex, and not fully sequenced plant genome such as that of sugarcane.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Brazilian Soc Plant Breeding
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
SUGARCANE
dc.subject
TARGETED SEQUENCE CAPTURE
dc.subject
SGS
dc.subject
FLANKING SEQUENCES
dc.subject
MULTIPLE INSERTS
dc.subject.classification
Tecnología GM, clonación de ganado, selección asistida, diagnósticos, tecnología de producción de biomasa, etc.
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dc.subject.classification
Biotecnología Agropecuaria
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dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS
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dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Identification of transgene flanking sequences in a pre-market safety assessed sugarcane in Argentina
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2022-05-23T22:26:04Z
dc.journal.volume
21
dc.journal.number
3
dc.journal.pagination
1-8
dc.journal.pais
Brasil
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dc.journal.ciudad
Viçosa
dc.description.fil
Fil: Enrique, R. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentina
dc.description.fil
Fil: Kurth, Daniel German. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ibarra Laclette, E. Instituto de Ecología Ac; México
dc.description.fil
Fil: Noguera, A. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentina
dc.description.fil
Fil: Welin, Björn. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentina
dc.description.fil
Fil: Castagnaro, Atilio Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentina
dc.journal.title
Crop Breeding And Applied Biotechnology
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1590/1984- 70332021v21n3a42
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://cbab.sbmp.org.br/wp-content/uploads/2021/10/3_AR_3686_2.pdf
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