Human Enterovirus Diversity by Next-Generation Sequencing Analysis in Urban Sewage Samples From Buenos Aires Metropolitan Area, Argentina: A Retrospective Study

Abstract

Los enterovirus humanos (hEV) son responsables de una amplia variedad de enfermedades humanas. Durante la infección por hEV, los viriones se excretan en las heces humanas y la vía fecal-oral es la principal vía de transmisión de persona a persona. La vigilancia de las aguas residuales podría ayudar a controlar la circulación de los vehículos eléctricos pesados ​​y describir su diversidad en una población específica. En este estudio, las muestras de aguas residuales recolectadas en el Área Metropolitana de Buenos Aires (Argentina) se estudiaron retrospectivamente a través de un enfoque de secuenciación profunda de amplicón y análisis filogenéticos para caracterizar la propagación de los hEV. Identificamos 17 tipos diferentes de hEV pertenecientes a las especies A, B y C. Hasta donde sabemos, este es el primer informe en Buenos Aires para 7 tipos identificados de hEV-C. Los análisis filogenéticos sugieren varias introducciones de coxsackievirus B4, echovirus 1 y echovirus 9 en el país. junto con la difusión nacional alcanzada por algunas variantes. Además, grupos monofiléticos bien sustentados de cepas argentinas, uruguayas y brasileñas revelaron patrones de circulación regional para algunas variantes. Estos resultados amplían nuestro conocimiento sobre la circulación de vehículos pesados ​​en Buenos Aires y podrían exhortar a las autoridades a implementar una vigilancia más activa de las aguas residuales en la región.