Evaluando la capacidad de unión de péptidos contra la proteína spike decoronavirus por métodos computacionales

Abstract

Los anticuerpos contra las glicoproteínas spike del coronavirus se utilizan comoherramientas para la caracterización de virus y enfoques terapéuticos. Sin embargo, eldesarrollo, la producción y el control de calidad de anticuerpos son costosas y requierenmucho tiempo. Para sortear estas dificultades, se han empleadoya en otros virusfragmentos derivados de anticuerpos que demostraron capacidad inhibitoria en otrosmodelos.En este trabajo, presentamos una aproximación inicial para el estudio de dospéptidosque se derivaron de regiones del receptor ACE2 de la glicoproteína spike delcoronavirus. Sus propiedades aglutinantes ya han sido estudiadas por métodosexperimentales, por lo que estudiamos en detalle por simulaciones de dinámicamolecular las interacciones responsables de su efectividad. Comentaremos sobreestrategias para mejorar la afinidad y adaptar la especificidad, y discutiremos yejemplificaremos. Así como han sido demostrados para el virus de la Influenza, estospéptidos y sus derivados tienen un potencial para el desarrollo de fármacos y para labiodetección.