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dc.contributor.author
Pisano, María Belén
dc.contributor.author
Culasso, Andrés Carlos Alberto
dc.contributor.author
Altabert, Nancy
dc.contributor.author
Martinez Wassaf, Maribel Graciela
dc.contributor.author
Nates, Silvia Viviana
dc.contributor.author
González, Jorge Enrique
dc.contributor.author
Contigiani de Minio, Marta Silvia
dc.contributor.author
Campos, Rodolfo Hector
dc.contributor.author
Ré, Viviana Elizabeth
dc.date.available
2022-02-17T21:27:54Z
dc.date.issued
2022-01
dc.identifier.citation
Pisano, María Belén; Culasso, Andrés Carlos Alberto; Altabert, Nancy; Martinez Wassaf, Maribel Graciela; Nates, Silvia Viviana; et al.; Phylogeography and evolutionary history of hepatitis E virus genotype 3 in Argentina; NLM (Medline); Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene; 116; 1; 1-2022; 34-42
dc.identifier.issn
0035-9203
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/152236
dc.description.abstract
BACKGROUND: Few studies about the evolutionary history of the hepatitis E virus (HEV) have been conducted. The aim of our work was to investigate and make inferences about the origin and routes of dispersion of HEV-3 in Argentina. METHODS: Phylogenetic, coalescent and phylogeographic analyses were performed using a 322-bp ORF2 genomic fragment of all HEV-3 sequences with known date and place of isolation published at GenBank until May 2018 (n=926), including 16 Argentinian sequences (isolated from pigs, water and humans). RESULTS: Phylogenetic analysis revealed two clades within HEV-3: abchij and efg. All Argentinian samples were grouped intermingled within clade 3abchij. The coalescent analysis showed that the most recent common ancestor for the clade 3abchij would have existed around the year 1967 (95% highest posterior density (HPD): 1963-1970). The estimated substitution rate was 1.01×10-2 (95%HPD: 9.3×10-3-1.09×10-2) substitutions/site/y, comparable with the rate previously described. The phylogeographic approach revealed a correspondence between phylogeny and place of origin for Argentinian samples, suggesting many HEV introductions in the country, probably from Europe and Japan. CONCLUSIONS: This is the first evolutionary inference of HEV-3 that includes Argentinian strains, showing the circulation of many HEV-3 subtypes, obtained from different sources and places, with recent diversification processes. ACCESSION NUMBERS: [KX812460], [KX812461], [KX812462], [KX812465], [KX812466], [KX812467], [KX812468], [KX812469].
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
NLM (Medline)
dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
ARGENTINA
dc.subject
EVOLUTION
dc.subject
GENOTYPE 3
dc.subject
HEPATITIS E VIRUS
dc.subject
PHYLOGEOGRAPHY
dc.subject.classification
Virología
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
Phylogeography and evolutionary history of hepatitis E virus genotype 3 in Argentina
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2022-02-09T14:26:58Z
dc.identifier.eissn
1878-3503
dc.journal.volume
116
dc.journal.number
1
dc.journal.pagination
34-42
dc.journal.pais
Reino Unido
dc.description.fil
Fil: Pisano, María Belén. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina
dc.description.fil
Fil: Culasso, Andrés Carlos Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina
dc.description.fil
Fil: Altabert, Nancy. Dirección Nacional de Instituto de Investigación.Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Martinez Wassaf, Maribel Graciela. LACE Laboratorios. Virología y Biología Molecular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Nates, Silvia Viviana. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentina
dc.description.fil
Fil: González, Jorge Enrique. Dirección Nacional de Instituto de Investigación.Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Contigiani de Minio, Marta Silvia. Dirección Nacional de Instituto de Investigación.Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Campos, Rodolfo Hector. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ré, Viviana Elizabeth. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina
dc.journal.title
Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://academic.oup.com/trstmh/article-abstract/116/1/34/6178877
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1093/trstmh/trab044
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