Mostrar el registro sencillo del ítem

dc.contributor.author
Sautua, Francisco J.  
dc.contributor.author
González, Sergio Alberto  
dc.contributor.author
Doyle, Vinson P.  
dc.contributor.author
Berretta, Marcelo Facundo  
dc.contributor.author
Gordo, Manuela  
dc.contributor.author
Scandiani, Mercedes M.  
dc.contributor.author
Rivarola, Maximo Lisandro  
dc.contributor.author
Fernandez, Paula del Carmen  
dc.contributor.author
Carmona, Marcelo Anibal  
dc.date.available
2021-12-01T18:46:01Z  
dc.date.issued
2019-12  
dc.identifier.citation
Sautua, Francisco J.; González, Sergio Alberto; Doyle, Vinson P.; Berretta, Marcelo Facundo; Gordo, Manuela; et al.; Draft genome sequence data of Cercospora kikuchii, a causal agent of Cercospora leaf blight and purple seed stain of soybeans; Elsevier; Data in Brief; 27; 12-2019; 1-7  
dc.identifier.issn
2352-3409  
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/147890  
dc.description.abstract
Cercospora kikuchii (Tak. Matsumoto & Tomoy.) M.W. Gardner 1927 is an ascomycete fungal pathogen that causes Cercospora leaf blight and purple seed stain on soybean. Here, we report the first draft genome sequence and assembly of this pathogen. The C. kikuchii strain ARG_18_001 was isolated from soybean purple seed collected from San Pedro, Buenos Aires, Argentina, during the 2018 harvest. The genome was sequenced using a 2 × 150 bp paired-end method by Illumina NovaSeq 6000. The C. kikuchii protein-coding genes were predicted using FunGAP (Fungal Genome Annotation Pipeline). The draft genome assembly was 33.1 Mb in size with a GC-content of 53%. The gene prediction resulted in 14,856 gene models/14,721 protein coding genes. Genomic data of C. kikuchii presented here will be a useful resource for future studies of this pathosystem. The data can be accessed at GenBank under the accession number VTAY00000000 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/VTAY00000000.  
dc.format
application/pdf  
dc.language.iso
eng  
dc.publisher
Elsevier  
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess  
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/  
dc.subject
AGRICULTURE  
dc.subject
BIOINFORMATICS  
dc.subject
CERCOSPORA KIKUCHII  
dc.subject
CERCOSPORA LEAF BLIGHT (CLB)  
dc.subject
DRAFT GENOME  
dc.subject
FUNGAL PATHOGENS  
dc.subject
NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS)  
dc.subject
PURPLE SEED STAIN (PSS)  
dc.subject.classification
Biotecnología Agrícola y Biotecnología Alimentaria  
dc.subject.classification
Biotecnología Agropecuaria  
dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS  
dc.title
Draft genome sequence data of Cercospora kikuchii, a causal agent of Cercospora leaf blight and purple seed stain of soybeans  
dc.type
info:eu-repo/semantics/article  
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo  
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion  
dc.date.updated
2021-03-05T18:48:48Z  
dc.journal.volume
27  
dc.journal.pagination
1-7  
dc.journal.pais
Alemania  
dc.description.fil
Fil: Sautua, Francisco J.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Vegetal. Cátedra de Fitopatología; Argentina  
dc.description.fil
Fil: González, Sergio Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Doyle, Vinson P.. No especifíca;  
dc.description.fil
Fil: Berretta, Marcelo Facundo. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Agrobiotecnologia y Biologia Molecular. Grupo Vinculado Instituto de Microbiologia y Zoologia Agrigola Al Iabimo | Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Agrobiotecnologia y Biologia Molecular. Grupo Vinculado Instituto de Microbiologia y Zoologia Agrigola Al Iabimo.; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Gordo, Manuela. Laboratorio Agrícola Río Paraná; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Scandiani, Mercedes M.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Rivarola, Maximo Lisandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Fernandez, Paula del Carmen. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Carmona, Marcelo Anibal. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Vegetal. Cátedra de Fitopatología; Argentina  
dc.journal.title
Data in Brief  
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2019.104693  
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352340919310480  

Archivos asociados
Thumbnail
 
Tamaño: 839.8Kb
Formato: PDF
.