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dc.contributor.author
Caparotta, Marcelo Rubén
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dc.contributor.author
Tomes, Claudia Nora
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dc.contributor.author
Mayorga, Luis Segundo
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dc.contributor.author
Masone, Diego Fernando
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dc.date.available
2021-09-21T13:35:03Z
dc.date.issued
2020-11
dc.identifier.citation
Caparotta, Marcelo Rubén; Tomes, Claudia Nora; Mayorga, Luis Segundo; Masone, Diego Fernando; The Synaptotagmin-1 C2B Domain Is a Key Regulator in the Stabilization of the Fusion Pore; American Chemical Society; Journal of Chemical Theory and Computation; 16; 12; 11-2020; 7840-7851
dc.identifier.issn
1549-9618
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/140993
dc.description.abstract
Fusion pores serve as an effective mechanism to connect intracellular organelles and release vesicle contents during exocytosis. A complex lipid rearrangement takes place as membranes approximate, bend, fuse, and establish a traversing water channel to define the fusion pore, linking initially isolated chambers. Thermodynamically, the process is unfavorable and thought to be mediated by specialized proteins. In this work, we have developed a reaction coordinate to induce fusion pores from initially flat and parallel lipid bilayers and we have used it to describe the effects of the synaptotagmin-1 C2B domain during the process. We have obtained free-energy profiles of the whole lipid reorganization in biologically realistic membranes, going from planar and parallel bilayers through stalk hemifusion to water channel formation. Our results point to a lysine-rich polybasic region on synaptotagmin-1 C2B as the key to lipid reorganization control through the formation of phosphatidylinositol bisphosphate clusters that stabilize the fusion pore.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
American Chemical Society
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
synaptotagmin
dc.subject
fusion pore
dc.subject
molecular dynamics
dc.subject
lipids
dc.subject.classification
Ciencias de la Información y Bioinformática
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dc.subject.classification
Ciencias de la Computación e Información
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
The Synaptotagmin-1 C2B Domain Is a Key Regulator in the Stabilization of the Fusion Pore
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2021-09-06T19:56:22Z
dc.journal.volume
16
dc.journal.number
12
dc.journal.pagination
7840-7851
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.journal.ciudad
Washington
dc.description.fil
Fil: Caparotta, Marcelo Rubén. Universidad Nacional de Cuyo; Argentina
dc.description.fil
Fil: Tomes, Claudia Nora. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina
dc.description.fil
Fil: Mayorga, Luis Segundo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina
dc.description.fil
Fil: Masone, Diego Fernando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina
dc.journal.title
Journal of Chemical Theory and Computation
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1021/acs.jctc.0c00734
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.0c00734
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