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dc.contributor.author
Naipauer, Julian
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dc.contributor.author
Garcia Sola, Martin Emilio
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dc.contributor.author
Salyakina, Daria
dc.contributor.author
Rosario, Santas
dc.contributor.author
Williams, Sion
dc.contributor.author
Coso, Omar Adrian
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dc.contributor.author
Abba, Martín Carlos
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dc.contributor.author
Mesri, Enrique Alfredo
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dc.contributor.author
Lacunza, Ezequiel
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dc.date.available
2021-07-27T18:44:15Z
dc.date.issued
2021-06-16
dc.identifier.citation
Naipauer, Julian; Garcia Sola, Martin Emilio; Salyakina, Daria; Rosario, Santas; Williams, Sion; et al.; A non-coding RNA network involved in KSHV tumorigenesis; Frontiers Media S.A.; Frontiers in Oncology; 11; 16-6-2021; 1-17
dc.identifier.issn
2234-943X
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/137090
dc.description.abstract
Regulatory pathways involving non-coding RNAs (ncRNAs), such as microRNAs (miRNAs) and long non-coding RNAs (lncRNA), have gained great relevance due to their role in the control of gene expression modulation. Using RNA sequencing of KSHV Bac36 transfected mouse endothelial cells (mECK36) and tumors, we have analyzed the host and viral transcriptome to uncover the role lncRNA-miRNA-mRNA driven networks in KSHV tumorigenesis. The integration of the differentially expressed ncRNAs, with an exhaustive computational analysis of their experimentally supported targets, led us to dissect complex networks integrated by the cancer-related lncRNAs Malat1, Neat1, H19, Meg3, and their associated miRNA-target pairs. These networks would modulate pathways related to KSHV pathogenesis, such as viral carcinogenesis, p53 signaling, RNA surveillance, and cell cycle control. Finally, the ncRNA-mRNA analysis allowed us to develop signatures that can be used to an appropriate identification of druggable gene or networks defining relevant AIDS-KS therapeutic targets.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Frontiers Media S.A.
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
dc.subject
LONG NON-CODING RNAS
dc.subject
MICRORNAS
dc.subject
NETWORK PATHWAYS
dc.subject
DRUGGABLE TARGETS
dc.subject
KSHV
dc.subject.classification
Virología
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
A non-coding RNA network involved in KSHV tumorigenesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2021-07-19T18:47:08Z
dc.journal.volume
11
dc.journal.pagination
1-17
dc.journal.pais
Suiza
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dc.description.fil
Fil: Naipauer, Julian. Miami University. School Of Medicine; Estados Unidos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina
dc.description.fil
Fil: Garcia Sola, Martin Emilio. Miami University. School Of Medicine; Estados Unidos. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina
dc.description.fil
Fil: Salyakina, Daria. Miami University. School Of Medicine; Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Rosario, Santas. Miami University. School Of Medicine; Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Williams, Sion. Miami University. School Of Medicine; Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Coso, Omar Adrian. Miami University. School Of Medicine; Estados Unidos. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina
dc.description.fil
Fil: Abba, Martín Carlos. Miami University. School Of Medicine; Estados Unidos. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Centro de Investigaciones Inmunológicas Básicas y Aplicadas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; Argentina
dc.description.fil
Fil: Mesri, Enrique Alfredo. Miami University. School Of Medicine; Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Lacunza, Ezequiel. Miami University. School Of Medicine; Estados Unidos. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Centro de Investigaciones Inmunológicas Básicas y Aplicadas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; Argentina
dc.journal.title
Frontiers in Oncology
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.3389/fonc.2021.687629
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fonc.2021.687629/full
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