Artículo
Bammds: a tool for assessing the ancestry of low-depth whole-genome data using multidimensional scaling (MDS)
Malaspinas, Anna Sapfo; Tange, Ole; Moreno Mayar, José Víctor; Rasmussen, Morten; DeGiorgio, Michael; Wang, Yong; Valdiosera, Cristina E.; Politis, Gustavo Gabriel
; Willerslev, Eske; Nielsen, Rasmus
; Willerslev, Eske; Nielsen, Rasmus
Fecha de publicación:
10/2014
Editorial:
Oxford University Press
Revista:
Bioinformatics (Oxford, England)
ISSN:
1367-4811
Idioma:
Inglés
Tipo de recurso:
Artículo publicado
Clasificación temática:
Resumen
SUMMARY: We present bammds, a practical tool that allows visualization of samples sequenced by second-generation sequencing when compared with a reference panel of individuals (usually genotypes) using a multidimensional scaling algorithm. Our tool is aimed at determining the ancestry of unknown samples-typical of ancient DNA data-particularly when only low amounts of data are available for those samples.
Palabras clave:
ANCESTROS
,
GENETIC
,
DNA
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Tamaño:
196.3Kb
Formato:
PDF
Licencia
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Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 2.5 Unported (CC BY-NC-SA 2.5)
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Articulos de INVESTIGACIONES ARQUEOLOGICAS Y PALEONTOLOGICAS DEL CUATERNARIO PAMPEANO
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Citación
Malaspinas, Anna Sapfo; Tange, Ole; Moreno Mayar, José Víctor; Rasmussen, Morten; DeGiorgio, Michael; et al.; Bammds: a tool for assessing the ancestry of low-depth whole-genome data using multidimensional scaling (MDS); Oxford University Press; Bioinformatics (Oxford, England); 30; 20; 10-2014; 2962-2964
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