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dc.contributor.author
Bezzi, Georgina
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dc.contributor.author
Piga Marra, Ernesto José
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dc.contributor.author
Binolfi, Andrés
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dc.contributor.author
Armas, Pablo
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dc.date.available
2021-07-07T01:32:21Z
dc.date.issued
2021-03-05
dc.identifier.citation
Bezzi, Georgina; Piga Marra, Ernesto José; Binolfi, Andrés; Armas, Pablo; CNBP binds and unfolds in vitro g-quadruplexes formed in the sars-cov-2 positive and negative genome strands; Multidisciplinary Digital Publishing Institute; International Journal of Molecular Sciences; 22; 5; 5-3-2021; 1-22
dc.identifier.issn
1661-6596
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/135602
dc.description.abstract
The Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) pandemic has become a global health emergency with no effective medical treatment and with incipient vaccines. It is caused by a new positive-sense RNA virus called severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2 (SARS-CoV-2). G-quadruplexes (G4s) are nucleic acid secondary structures involved in the control of a variety of biological processes including viral replication. Using several G4 prediction tools, we identified highly putative G4 sequences (PQSs) within the positive-sense (+gRNA) and negative-sense (−gRNA) RNA strands of SARS-CoV-2 conserved in related betacoronaviruses. By using multiple biophysical techniques, we confirmed the formation of two G4s in the +gRNA and provide the first evidence of G4 formation by two PQSs in the −gRNA of SARS-CoV-2. Finally, biophysical and molecular approaches were used to demonstrate for the first time that CNBP, the main human cellular protein bound to SARS-CoV-2 RNA genome, binds and promotes the unfolding of G4s formed by both strands of SARS-CoV-2 RNA genome. Our results suggest that G4s found in SARS-CoV-2 RNA genome and its negative-sense replicative intermediates, as well as the cellular proteins that interact with them, are relevant factors for viral genes expression and replication cycle, and may constitute interesting targets for antiviral drugs development.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Multidisciplinary Digital Publishing Institute
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
dc.subject
CNBP
dc.subject
CORONAVIRUS
dc.subject
COVID-19
dc.subject
G-QUADRUPLEX
dc.subject
SARS-COV-2
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
CNBP binds and unfolds in vitro g-quadruplexes formed in the sars-cov-2 positive and negative genome strands
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2021-07-05T18:16:41Z
dc.identifier.eissn
1422-0067
dc.journal.volume
22
dc.journal.number
5
dc.journal.pagination
1-22
dc.journal.pais
Suiza
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dc.journal.ciudad
Basel
dc.description.fil
Fil: Bezzi, Georgina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Piga Marra, Ernesto José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Binolfi, Andrés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina. Plataforma Argentina de Biología Estructural y Metabolómica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Armas, Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.journal.title
International Journal of Molecular Sciences
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.mdpi.com/1422-0067/22/5/2614
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.3390/ijms22052614
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