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dc.contributor.author
Pérez, Matías Gastón
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dc.contributor.author
Spiliotis, Markus
dc.contributor.author
Rego, Natalia
dc.contributor.author
Macchiaroli, Natalia
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dc.contributor.author
Kamenetzky, Laura
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dc.contributor.author
Holroyd, Nancy
dc.contributor.author
Cucher, Marcela Alejandra
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dc.contributor.author
Brehm, Klaus
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dc.contributor.author
Rosenzvit, Mara Cecilia
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dc.date.available
2021-06-24T13:54:15Z
dc.date.issued
2019-12
dc.identifier.citation
Pérez, Matías Gastón; Spiliotis, Markus; Rego, Natalia; Macchiaroli, Natalia; Kamenetzky, Laura; et al.; Deciphering the role of miR-71 in echinococcus multilocularis early development in vitro; Public Library of Science; Neglected Tropical Diseases; 13; 12; 12-2019; 1-21
dc.identifier.issn
1935-2735
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/134847
dc.description.abstract
Echinococcosis represents a major public health problem worldwide and is considered a neglected disease by the World Health Organization. The etiological agents are Echinococcus tapeworms, which display elaborate developmental traits that imply a complex control of gene expression. MicroRNAs (miRNAs), a class of small regulatory RNAs, are involved in the regulation of many biological processes such as development and metabolism. They act through the repression of messenger RNAs (mRNAs) usually by binding to the 3’ untranslated region (3’UTR). Previously, we described the miRNome of several Echinococcus species and found that miRNAs are highly expressed in all life cycle stages, suggesting an important role in gene expression regulation. However, studying the role of miRNAs in helminth biology remains a challenge. To develop methodology for functional analysis of miRNAs in tapeworms, we performed miRNA knockdown experiments in primary cell cultures of Echinococcus multilocularis, which mimic the development of metacestode vesicles from parasite stem cells in vitro. First, we analysed the miRNA repertoire of E. multilocularis primary cells by small RNA-seq and found that miR-71, a bilaterian miRNA absent in vertebrate hosts, is one of the top five most expressed miRNAs. Using genomic information and bioinformatic algorithms for miRNA binding prediction, we found a high number of potential miR-71 targets in E. multilocularis. Inhibition of miRNAs can be achieved by transfection of antisense oligonucleotides (anti-miRs) that block miRNA function. To this end, we evaluated a variety of chemically modified anti-miRs for miR-71 knockdown. Electroporation of primary cells with 2’-O-methyl modified anti-miR-71 led to significantly reduced miR-71 levels. Transcriptomic analyses showed that several predicted miR-71 targets were up-regulated in anti-miR-treated primary cells, including genes potentially involved in parasite development, host parasite interaction, and several genes of as yet unknown function. Notably, miR-71silenced primary cell cultures showed a strikingly different phenotype from control cells and did not develop into fully mature metacestodes. These findings indicate an important function of miR-71 in Echinococcus development and provide, for the first time, methodology to functionally study miRNAs in a tapeworm.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Public Library of Science
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
ECHINOCOCCUS MULTILOCULARIS
dc.subject
KNOCKDOWN
dc.subject
TAPEWORMS
dc.subject
MICRORNAS
dc.subject
MIR-71
dc.subject
TARGETS
dc.subject
RNASEQ
dc.subject
PRIMARY CELL CULTURE
dc.subject.classification
Parasitología
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dc.subject.classification
Ciencias de la Salud
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dc.subject.classification
CIENCIAS MÉDICAS Y DE LA SALUD
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dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Deciphering the role of miR-71 in echinococcus multilocularis early development in vitro
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2020-12-18T19:32:38Z
dc.journal.volume
13
dc.journal.number
12
dc.journal.pagination
1-21
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.journal.ciudad
San Francisco
dc.description.fil
Fil: Pérez, Matías Gastón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Spiliotis, Markus. Julius Maximilians Universitat Wurzburg. Institut Für Hygiene Und Mikrobiologie.; Alemania
dc.description.fil
Fil: Rego, Natalia. Instituto Pasteur de Montevideo; Uruguay
dc.description.fil
Fil: Macchiaroli, Natalia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Kamenetzky, Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Holroyd, Nancy. Wellcome Trust Sanger Institute; Reino Unido
dc.description.fil
Fil: Cucher, Marcela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Brehm, Klaus. Universität Würzburg; Alemania
dc.description.fil
Fil: Rosenzvit, Mara Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
dc.journal.title
Neglected Tropical Diseases
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://journals.plos.org/plosntds/article?id=10.1371/journal.pntd.0007932
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0007932
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