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dc.contributor.author
Daverio, Maria Silvana
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dc.contributor.author
Anello, Melina
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dc.contributor.author
Alcolea Ersinger, Victoria Florencia
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dc.contributor.author
Alvarez, Solange Vanesa
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dc.contributor.author
Frank, Eduardo Narciso
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dc.contributor.author
Vidal Rioja, Lidia A.
dc.contributor.author
Di Rocco, Florencia
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dc.date.available
2021-03-26T23:22:32Z
dc.date.issued
2019-06
dc.identifier.citation
Daverio, Maria Silvana; Anello, Melina; Alcolea Ersinger, Victoria Florencia; Alvarez, Solange Vanesa; Frank, Eduardo Narciso; et al.; Identification of llama KRTAP7-1 and KRTAP8-1 fiber genes and polymorphism screening; Elsevier Science; Journal of Small Ruminant Research; 175; 6-2019; 149-154
dc.identifier.issn
0921-4488
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/129103
dc.description.abstract
Keratin-associated proteins (KAP)are one of the main structural components of hair fiber. Within this protein group, high glycine tyrosine (HGT)-KAP play a crucial role in the definition of their physical-mechanical properties. Polymorphisms in HGT genes have been associated with the variation of different wool traits in sheeps and goats. The Argentine llama is a fiber-producing animal which is valued by the textile industry. However, the genes encoding for fiber proteins have not yet been identified in this species. Here, we focus on studying the HGT-KRTAP7-1 and KRTAP8-1 genes and their variation using the High Resolution Melting (HRM)technique in a sample of 117 llamas. Four single nucleotide polymorphisms (SNPs)were detected in KRTAP7-1, two of which were non-synonymous substitutions leading to amino acid changes in the protein. Of the 5 polymorphisms identified in KRTAP8-1, c.1-5A > G was located in the Kozak sequence, known to regulate protein synthesis level. The other four, two SNPs and one double nucleotide polymorphism (DNP), were found in the coding region and produced three amino acid replacement: c.43 T > C and c.45C > A (p.Y15Q), c.46 G > T (p.G16W)and c.173 A > G (p.Y58C). In summary, most of the polymorphisms found in both KRTAP7-1 and KRTAP8-1 genes produce non-conservative amino acid changes involving tyrosine and glycine residues, which are essential to maintain HGT protein properties. Therefore, these mutations as well as the regulatory SNP here identified could modify the fiber characteristics. We discuss the possible impact of these polymorphisms on KAP7-1 and KAP8-1 structure and/or interaction with other fiber proteins.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier Science
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights
Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Argentina (CC BY-NC-SA 2.5 AR)
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
HIGH RESOLUTION MELTING
dc.subject
KRTAP7-1
dc.subject
KRTAP8-1
dc.subject
LLAMA
dc.subject
POLYMORPHISMS
dc.subject.classification
Otras Ciencias Veterinarias
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dc.subject.classification
Ciencias Veterinarias
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dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS
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dc.title
Identification of llama KRTAP7-1 and KRTAP8-1 fiber genes and polymorphism screening
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2020-11-11T15:54:17Z
dc.journal.volume
175
dc.journal.pagination
149-154
dc.journal.pais
Países Bajos
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dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Daverio, Maria Silvana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Grupo Vinculado al IMBICE - Grupo de Biología Estructural y Biotecnología - Universidad Nacional de Quilmes - GBEyB | Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Grupo Vinculado al IMBICE - Grupo de Biología Estructural y Biotecnología - Universidad Nacional de Quilmes - GBEyB | Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Grupo Vinculado al IMBICE - Grupo de Biología Estructural y Biotecnología - Universidad Nacional de Quilmes - GBEyB; Argentina. Universidad Nacional de La Pampa. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ciencias Biológicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Anello, Melina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Alcolea Ersinger, Victoria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Alvarez, Solange Vanesa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Frank, Eduardo Narciso. Universidad Católica de Córdoba. Instituto de Investigaciones en Recursos Naturales y Sustentabilidad José Sanchez Labrador S. J. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Recursos Naturales y Sustentabilidad José Sanchez Labrador S. J.; Argentina
dc.description.fil
Fil: Vidal Rioja, Lidia A.. Universidad Católica de Córdoba; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Grupo Vinculado al IMBICE - Grupo de Biología Estructural y Biotecnología - Universidad Nacional de Quilmes - GBEyB | Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Grupo Vinculado al IMBICE - Grupo de Biología Estructural y Biotecnología - Universidad Nacional de Quilmes - GBEyB | Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Grupo Vinculado al IMBICE - Grupo de Biología Estructural y Biotecnología - Universidad Nacional de Quilmes - GBEyB; Argentina
dc.description.fil
Fil: Di Rocco, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
dc.journal.title
Journal of Small Ruminant Research
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0921448818305443?via%3Dihub
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1016/j.smallrumres.2019.04.016
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