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dc.contributor.author
Blanco Fernandez, Maria Dolores
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dc.contributor.author
Klumpp, Jochen
dc.contributor.author
Barrios, Melina E.
dc.contributor.author
Mbayed, Viviana Andrea
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dc.date.available
2021-03-25T11:42:10Z
dc.date.issued
2020-12
dc.identifier.citation
Blanco Fernandez, Maria Dolores; Klumpp, Jochen; Barrios, Melina E.; Mbayed, Viviana Andrea; Gene gain and loss and recombination shape evolution of Listeria bacteriophages of the genus Pecentumvirus; Academic Press Inc Elsevier Science; Genomics; 113; 1; 12-2020; 411-419
dc.identifier.issn
0888-7543
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/128890
dc.description.abstract
Listeria monocytogenes is an important food-borne pathogen and its bacteriophages are promising tools for its control in food and surfaces. Listeria bacteriophages belonging to the genus Pecentumvirus of the family Herelleviridae are strictly lytic, have a contractile tail and a large double stranded DNA genome (mean of 135.4 kb). We report the isolation and genome sequences of two new Pecentumvirus bacteriophages: vB_Lino_VEfB7 and vB_Liva_VAfA18. Twenty-one bacteriophages of this genus have been described and their genomes were used for the study of Pecentumvirus evolution. Analyses showed collinear genomes and gene gain and loss propensity and recombination events were distinctly found in two regions. A large potential recombination event (≈20 kB) was detected in P100 and vB_Liva_VAfA18. Phylogenetic analyses of multi-gene alignments showed that diversification events formed two groups of species distantly related.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Academic Press Inc Elsevier Science
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
dc.subject
BACTERIOPHAGE EVOLUTION
dc.subject
COMPARATIVE GENOMICS
dc.subject
LISTERIA
dc.subject
PECENTUMVIRUS
dc.subject.classification
Virología
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Gene gain and loss and recombination shape evolution of Listeria bacteriophages of the genus Pecentumvirus
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2021-03-15T15:47:54Z
dc.journal.volume
113
dc.journal.number
1
dc.journal.pagination
411-419
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.description.fil
Fil: Blanco Fernandez, Maria Dolores. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina
dc.description.fil
Fil: Klumpp, Jochen. Swiss Federal Institute of Technology Zurich; Suiza
dc.description.fil
Fil: Barrios, Melina E.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina
dc.description.fil
Fil: Mbayed, Viviana Andrea. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina
dc.journal.title
Genomics
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0888754320320474
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.ygeno.2020.12.003
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