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dc.contributor.author
Bejerman, Nicolas  
dc.contributor.author
Debat, Humberto Julio  
dc.contributor.author
Nome, Claudia  
dc.contributor.author
Cabrera Mederos, Dariel  
dc.contributor.author
Trucco, Verónica Milagros  
dc.contributor.author
de Breuil, Soledad  
dc.contributor.author
Lenardon, Sergio Luis  
dc.contributor.author
Giolitti, Fabián José  
dc.date.available
2021-02-25T11:58:34Z  
dc.date.issued
2019-05  
dc.identifier.citation
Bejerman, Nicolas; Debat, Humberto Julio; Nome, Claudia; Cabrera Mederos, Dariel; Trucco, Verónica Milagros; et al.; Redefining the medicago sativa alphapartitiviruses genome sequences; Elsevier Science; Virus Research; 265; 5-2019; 156-161  
dc.identifier.issn
0168-1702  
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/126529  
dc.description.abstract
In alfalfa samples analyzed by hightroughput sequencing, four de novo assembled contigs encoding gene products showing identities to alphapartitiviruses proteins were found based on BlastX analysis. The predicted amino acid (aa) sequences of two contigs presented 99–100% identity to the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) and the capsid protein (CP) of the recently reported medicago sativa alphapartitivirus 1 (MsAPV1). In addition, the remaining two contigs shared only 56% (CP) and 70% (RdRp) pairwise aa identity with the proteins of MsAPV1, suggesting that these samples presented also a novel Alphapartitivirus species. Further analyses based on complete genome segments termini and the presence/absence of alphapartitivirus RNA in several samples and public alfalfa RNA datasets corroborated the identification of two different alphapartitivirus members. Our results likely indicate that the reported MsAPV1 genome was previously reconstructed with genome segments of two different alphapartitiviruses. Overall, we not only revisited the MsAPV1 genome sequence but also report a new tentative alphapartitivirus species, which we propose the name medicago sativa alphapartitivirus 2. In addition, the RT-PCR detection of both MsAPV1 and MsAPV2 in several alfalfa cultivars suggests a broad distribution of both viruses.  
dc.format
application/pdf  
dc.language.iso
eng  
dc.publisher
Elsevier Science  
dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess  
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/  
dc.subject
ALPHAPARTITIVIRUS  
dc.subject
COMPLETE GENOMES  
dc.subject
MEDICAGO SATIVA  
dc.subject
VIRUS DISCOVERY  
dc.subject.classification
Virología  
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas  
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS  
dc.title
Redefining the medicago sativa alphapartitiviruses genome sequences  
dc.type
info:eu-repo/semantics/article  
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo  
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion  
dc.date.updated
2020-12-15T14:14:57Z  
dc.journal.volume
265  
dc.journal.pagination
156-161  
dc.journal.pais
Países Bajos  
dc.journal.ciudad
Amsterdam  
dc.description.fil
Fil: Bejerman, Nicolas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires; Argentina. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Debat, Humberto Julio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires; Argentina. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Nome, Claudia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires; Argentina. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Trucco, Verónica Milagros. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires; Argentina  
dc.description.fil
Fil: de Breuil, Soledad. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires; Argentina. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Lenardon, Sergio Luis. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Giolitti, Fabián José. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires; Argentina. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina  
dc.journal.title
Virus Research  
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0168170219300887  
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1016/j.virusres.2019.03.021