Detección y caracterización molecular del SARSCoV-2 en animales

Abstract

El potencial origen zoonótico del SARS-CoV-2 ha planteado la necesidad de realizar elmonitoreo y control de esta virosis en animales domésticos y silvestres para determinar el posiblerol de los animales como portadores, reservorios y/o amplificadores del virus. Los estudios paracomprender mejor la susceptibilidad de diferentes especies animales al SARS-CoV-2 y evaluar ladinámica de la infección en estas especies, así como también la identificación de posiblesreservorios y/o transmisores, son una herramienta fundamental para la vigilancia de lapandemia. El diseño de protocolos específicos para el relevamiento epidemiológico y la toma demuestras de animales pertenecientes a pacientes positivos a COVID-19, dieron inicio al trabajo.Los objetivos del proyecto involucran el diagnóstico y la vigilancia epidemiológica del SARS-CoV-2en animales que conviven con personas infectadas, para analizar la infectividad potencial delvirus y el rol que cumplen los animales en la pandemia. Estos estudios son una herramienta quenos permitirá conocer el comportamiento del virus en diferentes hospedadores y sus implicanciasen la transmisión y perpetuación de la infección.El proyecto comenzó con el diseño de protocolos para toma de muestras, definiendo casosospechoso en animales, e indicando cómo debe proceder el Médico Veterinario particular al serconsultado por los propietarios. Dicho protocolo fue difundido por el Colegio de Veterinarios dela Provincia de Buenos Aires (Distrito II). Conjuntamente, se creó un consentimiento informado,aprobado por la Comisión Institucional para el Cuidado y Uso de Animales de Laboratorio(CICUAL) que es firmado por los responsables de los animales y del proyecto, acordando la tomade muestras. Por otro lado, el área de zoonosis dependiente del Ministerio de Salud de la Naciónadoptó los protocolos y trabaja en la implementación de un sistema de vigilancia epidemiológica.Se realizó la difusión del proyecto en diversos medios de comunicación, permitiendo que aquellos pacientes diagnosticados positivos a SARS-CoV-2 se comunicaran con el grupo de trabajo paraconsultas y coordinación de la toma de muestras a sus mascotas.Hasta el 31 de agosto, se tomaron muestras de hisopados orofaríngeos y rectales de 15 caninosy 11 felinos, todos en estrecho contacto con personas diagnosticados positivos a SARS-CoV-2.Además, se colectaron muestras de un chimpancé del Ecoparque La Plata. Una vez en ellaboratorio se realizó la extracción del ARN de las muestras utilizando un kit comercial, y eldiagnóstico molecular por real-time RT-PCR adaptando kits comerciales. Las muestras analizadasfueron no reactivas a los targets específicos de SARS-CoV-2.

The zoonotic potential origin of the SARS-CoV-2 has raised the necessity to monitor and control the virus in domestic and wild animals to determine the possible role of the animals as carriers, reservoirs and / or virus amplifiers. Studies to understand the susceptibility of different animals to SARS-CoV-2 and to evaluate the dynamics of the infection, identification of the possible reservoirs and / or transmitters, are fundamental tools for the surveillance of the pandemic. The design of specific protocols for the epidemiological survey and for taking samples of pets belonging to positive COVID-19 owners began the work. The goals of the project involve the diagnosis and epidemiological control of SARS-CoV-2 in animals that live with infected people, the analysis of the potential infectivity of the virus and the role that animals play in the pandemic. These studies are an instrument that will allow us to know the infectivity of the virus in different hosts and its implications in the transmission and perpetuation of the infection. The project began with the design of protocols for animal sampling, defining a suspected case and specifying how a particular veterinarian should proceed when asked by the positive SARS-CoV-2 owners. Said protocol was published by the Veterinary College of the Buenos Aires Province (District II). An informed agreement was created, approved by the Institutional Commission for the Care and Use of Laboratory Animals (CICUAL). The agreement is signed by those responsible for the animals and the project director, approving to take samples. On the other hand, the zoonosis area dependent on the National Ministry of Health adopted the protocols and is working on the implementation of an epidemiological surveillance system. The project contents and objectives was distributed in various media, allowing those SARS-CoV-2 owners diagnosed positive to communicate with members of the project for consultations and coordination for pets sampling. To August 31, rectal and oropharyngeal swabs were collected from 15 canines and 11 felines, all in close contact with people diagnosed positive for SARS-CoV-2. In addition, samples were collected from a chimpanzee from Ecopaque La Plata. Once in the laboratory, the RNA was extracted from the samples using a commercial kit, and the molecular diagnosis by real-time RT-PCR was carried out adapting commercial kits. The samples tested were non-reactive to the specific targets of SARSCoV-2.