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dc.contributor.author
Lucero, Leandro Exequiel
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dc.contributor.author
Bazin, Jeremie
dc.contributor.author
Rodriguez Melo, Johan Stiben
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dc.contributor.author
Ibañez, Fernando Julio
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dc.contributor.author
Crespi, Leandro Martín
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dc.contributor.author
Ariel, Federico Damian
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dc.date.available
2021-01-26T13:44:37Z
dc.date.issued
2020-02
dc.identifier.citation
Lucero, Leandro Exequiel; Bazin, Jeremie; Rodriguez Melo, Johan Stiben; Ibañez, Fernando Julio; Crespi, Leandro Martín; et al.; Evolution of the small family of alternative splicing modulators nuclear speckle RNA-binding proteins in plants; Molecular Diversity Preservation International; Genes; 11; 2; 2-2020; 1-13
dc.identifier.issn
2073-4425
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/123704
dc.description.abstract
RNA-Binding Protein 1 (RBP1) was first identified as a protein partner of the long noncoding RNA (lncRNA) ENOD40 in Medicago truncatula, involved in symbiotic nodule development. RBP1 is localized in nuclear speckles and can be relocalized to the cytoplasm by the interaction with ENOD40. The two closest homologs to RBP1 in Arabidopsis thaliana were called Nuclear Speckle RNA-binding proteins (NSRs) and characterized as alternative splicing modulators of specific mRNAs. They can recognize in vivo the lncRNA ALTERNATIVE SPLICING COMPETITOR (ASCO) among other lncRNAs, regulating lateral root formation. Here, we performed a phylogenetic analysis of NSR/RBP proteins tracking the roots of the family to the Embryophytes. Strikingly, eudicots faced a reductive trend of NSR/RBP proteins in comparison with other groups of flowering plants. In Medicago truncatula and Lotus japonicus, their expression profile during nodulation and in specific regions of the symbiotic nodule was compared to that of the lncRNA ENOD40, as well as to changes in alternative splicing. This hinted at distinct and specific roles of each member during nodulation, likely modulating the population of alternatively spliced transcripts. Our results establish the basis to guide future exploration of NSR/RBP function in alternative splicing regulation in different developmental contexts along the plant lineage.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Molecular Diversity Preservation International
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dc.relation
https://www.mdpi.com/journal/genes/special_issues/root_nodule_symbioses
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
dc.subject
ALTERNATIVE SPLICING
dc.subject
EVOLUTION
dc.subject
LEGUMES
dc.subject
LNCRNA ENOD40
dc.subject
NUCLEAR SPECKLE RNA-BINDING PROTEINS
dc.subject
RBP1
dc.subject
SYMBIOTIC NODULE DEVELOPMENT
dc.subject.classification
Biotecnología Agrícola y Biotecnología Alimentaria
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dc.subject.classification
Biotecnología Agropecuaria
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dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS
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dc.title
Evolution of the small family of alternative splicing modulators nuclear speckle RNA-binding proteins in plants
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2020-12-22T15:47:26Z
dc.journal.volume
11
dc.journal.number
2
dc.journal.pagination
1-13
dc.journal.pais
Suiza
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dc.journal.ciudad
Basilea
dc.description.fil
Fil: Lucero, Leandro Exequiel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral; Argentina
dc.description.fil
Fil: Bazin, Jeremie. Université Paris-sud; Francia. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia. Institut National de la Recherche Agronomique; Francia
dc.description.fil
Fil: Rodriguez Melo, Johan Stiben. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ibañez, Fernando Julio. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Crespi, Leandro Martín. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia. Institut National de la Recherche Agronomique; Francia. Université Paris-sud; Francia
dc.description.fil
Fil: Ariel, Federico Damian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral; Argentina
dc.journal.title
Genes
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.mdpi.com/2073-4425/11/2/207
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.3390/genes11020207
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