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Alló, Mariano
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dc.contributor.author
Agirre, Eneritz
dc.contributor.author
Bessonov, Sergey
dc.contributor.author
Bertucci, Paola Yanina
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dc.contributor.author
Gómez Acuña, Luciana Inés
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Buggiano, Valeria Carmen
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Bellora, Nicolás
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Singh, Babita
dc.contributor.author
Petrillo, Ezequiel
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dc.contributor.author
Blaustein Kappelmacher, Matias
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dc.contributor.author
Miñana, Belén
dc.contributor.author
Dujardin, Gwendal
dc.contributor.author
Pozzi, Berta
dc.contributor.author
Pelisch, Federico Gaston
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dc.contributor.author
Bechara, Elías
dc.contributor.author
Agafonov, Dmitry E.
dc.contributor.author
Srebrow, Anabella
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dc.contributor.author
Lührmann, Reinhard
dc.contributor.author
Valcárcel, Juan
dc.contributor.author
Eyras, Eduardo
dc.contributor.author
Kornblihtt, Alberto Rodolfo
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dc.date.available
2017-02-02T16:02:28Z
dc.date.issued
2014-10
dc.identifier.citation
Alló, Mariano; Agirre, Eneritz; Bessonov, Sergey; Bertucci, Paola Yanina; Gómez Acuña, Luciana Inés; et al.; Argonaute-1 binds transcriptional enhancers and controls constitutive and alternative splicing in human cells; National Academy Of Sciences; Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America; 111; 44; 10-2014; 15622-15629
dc.identifier.issn
0027-8424
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/12356
dc.description.abstract
The roles of Argonaute proteins in cytoplasmic microRNA and RNAi pathways are well established. However, their implication in small RNA-mediated transcriptional gene silencing in the mammalian cell nucleus is less understood. We have recently shown that intronic siRNAs cause chromatin modifications that inhibit RNA polymerase II elongation and modulate alternative splicing in an Argonaute-1 (AGO1)-dependent manner. Here we used chromatin immunoprecipitation followed by deep sequencing (ChIP-seq) to investigate the genome-wide distribution of AGO1 nuclear targets. Unexpectedly, we found that about 80% of AGO1 clusters are associated with cell-type-specific transcriptional enhancers, most of them (73%) overlapping active enhancers. This association seems to be mediated by long, rather than short, enhancer RNAs and to be more prominent in intragenic, rather than intergenic, enhancers. Paradoxically, crossing ChIP-seq with RNA-seq data upon AGO1 depletion revealed that enhancer-bound AGO1 is not linked to the global regulation of gene transcription but to the control of constitutive and alternative splicing, which was confirmed by an individual gene analysis explaining how AGO1 controls inclusion levels of the cassette exon 107 in the SYNE2 gene.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
National Academy Of Sciences
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Cromatina
dc.subject
Splicing Alternativo
dc.subject
Proteina Argonauta
dc.subject
Enhancer Transcripcional
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Argonaute-1 binds transcriptional enhancers and controls constitutive and alternative splicing in human cells
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2016-12-12T14:28:21Z
dc.journal.volume
111
dc.journal.number
44
dc.journal.pagination
15622-15629
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.journal.ciudad
Washington DC
dc.description.fil
Fil: Alló, Mariano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Agirre, Eneritz. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil
Fil: Bessonov, Sergey. Max Planck Institute For Biophysical Chemistry; Alemania
dc.description.fil
Fil: Bertucci, Paola Yanina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Gómez Acuña, Luciana Inés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Buggiano, Valeria Carmen. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Bellora, Nicolás. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil
Fil: Singh, Babita. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil
Fil: Petrillo, Ezequiel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina
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Fil: Blaustein Kappelmacher, Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina
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Fil: Miñana, Belén. Universitat Pompeu Fabra; España. Centre for Genomic Regulation; España
dc.description.fil
Fil: Dujardin, Gwendal. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina
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Fil: Pozzi, Berta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina
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Fil: Pelisch, Federico Gaston. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina
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Fil: Bechara, Elías. Universitat Pompeu Fabra; España. Centre for Genomic Regulation; España
dc.description.fil
Fil: Agafonov, Dmitry E.. Max Planck Institute For Biophysical Chemistry; Alemania
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Fil: Srebrow, Anabella. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina
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Fil: Lührmann, Reinhard. Max Planck Institute For Biophysical Chemistry; Alemania
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Fil: Valcárcel, Juan. Universitat Pompeu Fabra; España. Institució Catalana de Recerca i Estudis Avancats; España
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Fil: Eyras, Eduardo. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil
Fil: Kornblihtt, Alberto Rodolfo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina
dc.journal.title
Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.pnas.org/content/111/44/15622.abstract
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4226100/
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1416858111
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