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dc.contributor.author
Fontana, Paola
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dc.contributor.author
Tomasini, Nicolás
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dc.contributor.author
Fontana, Cecilia Alejandra
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dc.contributor.author
Di Pauli, Valentina
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dc.contributor.author
Cocconcelli, Pier Sandro
dc.contributor.author
Vignolo, Graciela Margarita
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dc.contributor.author
Salazar, Sergio Miguel
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dc.date.available
2020-12-15T21:00:37Z
dc.date.issued
2019-03
dc.identifier.citation
Fontana, Paola; Tomasini, Nicolás; Fontana, Cecilia Alejandra; Di Pauli, Valentina; Cocconcelli, Pier Sandro; et al.; MLST reveals a separate and novel clonal group for acidovorax avenae strains causing red stripe in sugarcane from Argentina; American Phytopathological Society; Phytopathology; 109; 3; 3-2019; 358-365
dc.identifier.issn
0031-949X
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/120536
dc.description.abstract
Acidovorax spp. cause a wide range of economically important diseases in monocotyledonous and dicotyledonous plants, including sugarcane, corn, rice, oat, millet, foxtail watermelon, and orchid. In Argentina, the red stripe disease of sugarcane caused by Acidovorax avenae affects 30% of the milling stems with important economic losses. To explore the genetic diversity of this bacterium associated with red stripe in Argentina, multilocus sequence typing (MLST) was applied. This study included 15 local strains isolated from four different sugarcane planting regions and selected after random amplified polymorphic DNA analysis and reference strains of A. citrulli, A. avenae, and A. oryzae to investigate their phylogenetic relationships. MLST analysis resulted in five sequence types among the sugarcane A. avenae strains which constitute a clonal complex, meaning a common and close origin. Sugarcane strains were related to A. avenae from other hosts and distant to A. citrulli. Signals of frequent recombination in several lineages of A. avenae was detected and we observed that A. oryzae is closely related to A. avenae strains. This study provides valuable data in the field of epidemiological and evolutionary investigations of novel clone of A. avenae strains causing sugarcane red stripe. The knowledge of the genetic diversity and strain-host specificity are important to select the genotypes with the best response to the red stripe disease.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
American Phytopathological Society
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
ACIDOVORAX AVENAE
dc.subject
SUGARCANE
dc.subject
RED STRIPE
dc.subject
MLST
dc.subject
ACIDOVORAX AVENAE
dc.subject
SUGARCANE
dc.subject
RED STRIPE
dc.subject
MLST
dc.subject.classification
Otras Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
MLST reveals a separate and novel clonal group for acidovorax avenae strains causing red stripe in sugarcane from Argentina
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2019-12-11T20:15:19Z
dc.journal.volume
109
dc.journal.number
3
dc.journal.pagination
358-365
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.description.fil
Fil: Fontana, Paola. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucuman-Santiago del Estero. Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentina
dc.description.fil
Fil: Tomasini, Nicolás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; Argentina
dc.description.fil
Fil: Fontana, Cecilia Alejandra. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucuman-Santiago del Estero. Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentina
dc.description.fil
Fil: Di Pauli, Valentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucuman-Santiago del Estero. Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentina
dc.description.fil
Fil: Cocconcelli, Pier Sandro. Università Cattolica del Sacro Cuore; Italia
dc.description.fil
Fil: Vignolo, Graciela Margarita. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Centro de Referencia para Lactobacilos; Argentina
dc.description.fil
Fil: Salazar, Sergio Miguel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucuman-Santiago del Estero. Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentina
dc.journal.title
Phytopathology
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://apsjournals.apsnet.org/loi/phyto
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1094/PHYTO-08-18-0303-R
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://apsjournals.apsnet.org/doi/10.1094/PHYTO-08-18-0303-R
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