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dc.contributor.author
Besso, María José
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dc.contributor.author
Montivero, Luciana
dc.contributor.author
Lacunza, Ezequiel
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dc.contributor.author
Argibay, María Cecilia
dc.contributor.author
Abba, Martín Carlos
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dc.contributor.author
Furlong, Laura Ines
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dc.contributor.author
Colas, Eva
dc.contributor.author
Gil Moreno, Antonio
dc.contributor.author
Reventos, Jaume
dc.contributor.author
Bello, Ricarlo
dc.contributor.author
Vazquez, Monica Hebe
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dc.date.available
2020-08-27T18:20:38Z
dc.date.issued
2020-06
dc.identifier.citation
Besso, María José; Montivero, Luciana; Lacunza, Ezequiel; Argibay, María Cecilia; Abba, Martín Carlos; et al.; Identification of early stage recurrence endometrial cancer biomarkers using bioinformatics tools; Boletim do Instituto de Pesca; Oncology Reports; 44; 3; 6-2020; 873-886
dc.identifier.issn
1021-335X
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/112581
dc.description.abstract
Endometrial cancer (EC) is the sixth most common cancer in women worldwide. Early diagnosis is critical in recurrent EC management. The present study aimed to identify biomarkers of EC early recurrence using a workflow that combined text and data mining databases (DisGeNET, Gene Expression Omnibus), a prioritization algorithm to select a set of putative candidates (ToppGene), protein‑protein interaction network analyses (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes, cytoHubba), association analysis of selected genes with clinicopathological parameters, and survival analysis (Kaplan‑Meier and Cox proportional hazard ratio analyses) using a The Cancer Genome Atlas cohort. A total of 10 genes were identified, among which the targeting protein for Xklp2 (TPX2) was the most promising independent prognostic biomarker in stage I EC. TPX2 expression (mRNA and protein) was higher (P<0.0001 and P<0.001, respectively) in ETS variant transcription factor 5‑overexpressing Hec1a and Ishikawa cells, a previously reported cell model of aggressive stage I EC. In EC biopsies, TPX2 mRNA expression levels were higher (P<0.05) in high grade tumors (grade 3) compared with grade 1‑2 tumors (P<0.05), in tumors with deep myometrial invasion (>50% compared with <50%; P<0.01), and in intermediate‑high recurrence risk tumors compared with low‑risk tumors (P<0.05). Further validation studies in larger and independent EC cohorts will contribute to confirm the prognostic value of TPX2.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Boletim do Instituto de Pesca
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
dc.subject
Molecular Oncology
dc.subject
Endometrial Cancer
dc.subject
Bioinformatics
dc.subject
Biomarkers
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Identification of early stage recurrence endometrial cancer biomarkers using bioinformatics tools
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2020-08-24T18:08:10Z
dc.identifier.eissn
1791-2431
dc.journal.volume
44
dc.journal.number
3
dc.journal.pagination
873-886
dc.journal.pais
Grecia
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dc.journal.ciudad
Atenas
dc.description.fil
Fil: Besso, María José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina
dc.description.fil
Fil: Montivero, Luciana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina
dc.description.fil
Fil: Lacunza, Ezequiel. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Centro de Investigaciones Inmunológicas Básicas y Aplicadas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; Argentina
dc.description.fil
Fil: Argibay, María Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina
dc.description.fil
Fil: Abba, Martín Carlos. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Centro de Investigaciones Inmunológicas Básicas y Aplicadas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; Argentina
dc.description.fil
Fil: Furlong, Laura Ines. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil
Fil: Colas, Eva. Universitat Autònoma de Barcelona; España
dc.description.fil
Fil: Gil Moreno, Antonio. Universitat Autònoma de Barcelona; España
dc.description.fil
Fil: Reventos, Jaume. Universitat Autònoma de Barcelona; España
dc.description.fil
Fil: Bello, Ricarlo. Universidad Nacional de Tres de Febrero. Departamento de Metodología, Estadística y Matemáticas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Vazquez, Monica Hebe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina
dc.journal.title
Oncology Reports
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.spandidos-publications.com/10.3892/or.2020.7648
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.3892/or.2020.7648
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