Mostrar el registro sencillo del ítem
dc.contributor.author
Iserte, Javier Alonso
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.contributor.author
Simonetti, Franco Lucio
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.contributor.author
Zea, Diego Javier
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.contributor.author
Teppa, Roxana Elin
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.contributor.author
Marino, Cristina Ester
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.date.available
2016-12-28T17:08:48Z
dc.date.issued
2015-07
dc.identifier.citation
Iserte, Javier Alonso; Simonetti, Franco Lucio; Zea, Diego Javier; Teppa, Roxana Elin; Marino, Cristina Ester; I-COMS: Interprotein-COrrelated Mutations Server; Oxford University Press; Nucleic Acids Research; 14; W1; 7-2015; W320-W325
dc.identifier.issn
0305-1048
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/10480
dc.description.abstract
Interprotein contact prediction using multiple sequence alignments (MSAs) is a useful approach to help detect protein-protein interfaces. Different computational methods have been developed in recent years as an approximation to solve this problem. However, as there are discrepancies in the results provided by them, there is still no consensus on which is the best performing methodology. To address this problem, I-COMS (interprotein COrrelated Mutations Server) is presented. I-COMS allows to estimate covariation between residues of different proteins by four different covariation methods. It provides a graphical and interactive output that helps compare results obtained using different methods. I-COMS automatically builds the required MSA for the calculation and produces a rich visualization of either intraprotein and/or interprotein covariating positions in a circos representation. Furthermore, comparison between any two methods is available as well as the overlap between any or all four methodologies. In addition, as a complementary source of information, a matrix visualization of the corresponding scores is made available and the density plot distribution of the inter, intra and inter+intra scores are calculated. Finally, all the results can be downloaded (including MSAs, scores and graphics) for comparison and visualization and/or for further analysis.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Oxford University Press
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Protein-Protein Interactions
dc.subject
Coevolution
dc.subject
Covariation
dc.subject.classification
Ciencias de la Información y Bioinformática
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.subject.classification
Ciencias de la Computación e Información
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.title
I-COMS: Interprotein-COrrelated Mutations Server
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2016-12-16T17:25:59Z
dc.journal.volume
14
dc.journal.number
W1
dc.journal.pagination
W320-W325
dc.journal.pais
Reino Unido
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.journal.ciudad
Oxford
dc.description.fil
Fil: Iserte, Javier Alonso. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; Argentina
dc.description.fil
Fil: Simonetti, Franco Lucio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; Argentina
dc.description.fil
Fil: Zea, Diego Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; Argentina
dc.description.fil
Fil: Teppa, Roxana Elin. Fundación Instituto Leloir; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil
Fil: Marino, Cristina Ester. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; Argentina
dc.journal.title
Nucleic Acids Research
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://nar.oxfordjournals.org/content/43/W1/W320
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv572
Archivos asociados