Mostrar el registro sencillo del ítem
dc.contributor.author
Fuchs Wightman, Federico
dc.contributor.author
Lukin, Jeronimo
dc.contributor.author
Giusti, Sebastian Alejandro
dc.contributor.author
Soutschek, Michael
dc.contributor.author
Bragado, Laureano Fabian Tomas
dc.contributor.author
Pozzi, María Berta
dc.contributor.author
Gonzalez, Paula
dc.contributor.author
Fededa, Juan Pablo
dc.contributor.author
Schratt, Gerhard
dc.contributor.author
Refojo, Damian
dc.contributor.author
de la Mata, Manuel
dc.date.available
2023-10-25T13:51:46Z
dc.date.issued
2022-04
dc.identifier.citation
Fuchs Wightman, Federico; Lukin, Jeronimo; Giusti, Sebastian Alejandro; Soutschek, Michael; Bragado, Laureano Fabian Tomas; et al.; Influence of circular RNA topology on microRNA stability; Cold Spring Harbor Laboratory Press; BioRxiv; 2023; 4-2022; 1-46
dc.identifier.issn
2692-8205
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/215854
dc.description.abstract
A subset of circular RNAs (circRNAs) and linear RNAs have been proposed to “sponge” or block microRNA activity. Additionally, certain RNAs induce microRNA destruction through the process of Target RNA-Directed MicroRNA Degradation (TDMD), but whether both linear and circular transcripts are equivalent in driving TDMD is unknown. Here we study whether circular/linear topology of endogenous and artificial RNA targets affects TDMD. Consistent with previous knowledge that Cdr1as (ciRS-7) circular RNA protects miR-7 from Cyrano-mediated TDMD, we demonstrate that depletion of Cdr1as reduces miR-7 abundance. In contrast, overexpression of an artificial linear version of Cdr1as drives miR-7 degradation. Using plasmids that express a circRNA with minimal co-expressed cognate linear RNA, we show differential effects on TDMD that cannot be attributed to the nucleotide sequence, as the TDMD properties of a sequence often differ between its circular and linear forms. By analysing RNA sequencing data of a neuron differentiation system, we further detect potential effects of circRNAs on microRNA stability. Our results support the view that RNA circularity influences TDMD, either enhancing or inhibiting it on specific microRNAs.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Cold Spring Harbor Laboratory Press
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
dc.subject
MIRNA
dc.subject
CIRCRNA
dc.subject
TDMD
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
Influence of circular RNA topology on microRNA stability
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2023-06-30T10:48:07Z
dc.journal.volume
2023
dc.journal.pagination
1-46
dc.journal.pais
Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Fuchs Wightman, Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina
dc.description.fil
Fil: Lukin, Jeronimo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; Argentina
dc.description.fil
Fil: Giusti, Sebastian Alejandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; Argentina
dc.description.fil
Fil: Soutschek, Michael. Eidgenossische Technische Hochschule zurich (eth Zurich); . Universitat Zurich; Suiza
dc.description.fil
Fil: Bragado, Laureano Fabian Tomas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina
dc.description.fil
Fil: Pozzi, María Berta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina. University of Bern; Suiza
dc.description.fil
Fil: Gonzalez, Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Fededa, Juan Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Schratt, Gerhard. Eidgenossische Technische Hochschule zurich (eth Zurich); . Universitat Zurich; Suiza
dc.description.fil
Fil: Refojo, Damian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; Argentina
dc.description.fil
Fil: de la Mata, Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Fisiología, Biología Molecular y Neurociencias; Argentina
dc.journal.title
BioRxiv
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.04.11.487822v4
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1101/2022.04.11.487822
Archivos asociados