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dc.contributor.author
Nisenbaum, Melina
dc.contributor.author
Maldonado, Emilio Alfredo
dc.contributor.author
Martinez Arca, Jorge
dc.contributor.author
Gonzalez, Jorge Froilan
dc.contributor.author
Passoni, Lucía Isabel
dc.contributor.author
Murialdo, Silvia Elena
dc.date.available
2018-01-24T21:22:25Z
dc.date.issued
2016-06-09
dc.identifier.citation
Nisenbaum, Melina; Maldonado, Emilio Alfredo; Martinez Arca, Jorge; Gonzalez, Jorge Froilan; Passoni, Lucía Isabel; et al.; Video processing analysis for the determination and evaluation of the chemotactic response in bacterial populations; Elsevier; Journal Of Microbiological Methods; 127; 9-6-2016; 146-153
dc.identifier.issn
0167-7012
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/34534
dc.description.abstract
The aim of the present work was to design a methodology based on video processing to obtain indicators of bacterial population motility that allow the quantitative and qualitative analysis and comparison of the chemotactic phenomenon with different attractants in the agarose-in plug bridge method. Video image sequences were processed applying Shannon´s entropy to the intensity time series of each pixel, which conducted to a final pseudo colored image resembling a map of the dynamic bacterial clusters. Processed images could discriminate perfectly between positive and negative attractant responses at different periods of time from the beginning of the assay. An index of spatial and temporal motility was proposed to quantify the bacterial response. With this index, this video processing method allowed obtaining quantitative information of the dynamic changes in space and time from a traditional qualitative assay. We conclude that this computational technique, applied to the traditional agarose-in plug assay, has demonstrated good sensitivity for identifying chemotactic regions with a broad range of motility.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Agarose-In Plug Bridge Method
dc.subject
Bacteria Chemotaxis
dc.subject
Video Digital Processing
dc.subject
Shannon Entropy
dc.subject.classification
Ciencias de la Computación
dc.subject.classification
Ciencias de la Computación e Información
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
Video processing analysis for the determination and evaluation of the chemotactic response in bacterial populations
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2018-01-18T14:16:07Z
dc.journal.volume
127
dc.journal.pagination
146-153
dc.journal.pais
Países Bajos
dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Nisenbaum, Melina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Departamento de Ingeniería Química. Grupo de Ingeniería Bioquímica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Maldonado, Emilio Alfredo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Científicas y Tecnológicas En Electronica. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Instituto de Investigaciones Científicas y Tecnológicas En Electronica.; Argentina
dc.description.fil
Fil: Martinez Arca, Jorge. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Científicas y Tecnológicas En Electronica. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Instituto de Investigaciones Científicas y Tecnológicas En Electronica.; Argentina
dc.description.fil
Fil: Gonzalez, Jorge Froilan. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Departamento de Ingeniería Química. Grupo de Ingeniería Bioquímica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Passoni, Lucía Isabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Científicas y Tecnológicas En Electronica. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Instituto de Investigaciones Científicas y Tecnológicas En Electronica.; Argentina
dc.description.fil
Fil: Murialdo, Silvia Elena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Departamento de Ingeniería Química. Grupo de Ingeniería Bioquímica; Argentina
dc.journal.title
Journal Of Microbiological Methods
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S016770121630135X
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.mimet.2016.06.006
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