Genómica aplicada al estudio de los microorganismos del suelo

Abstract

La genómica edáfica involucra el estudio en conjunto de los genomas de los organismos que habitan el suelo. Nos brinda información sobre la estructura y diversidad de las comunidades microbianas y permite caracterizarlas a nivel funcional.Los estudios de secuenciación masiva en general involucran el envío de muestras de ADN a servicios de secuenciación tercerizados, cuyos costos se han reducido en forma constante en los últimos años, pero que continúan siendo una característica limitante en nuestro país. El siguiente desafío lo constituye el análisis bioinformático y la escasez de recursos humanos formados en este aspecto. Sumado a esto, el diseño experimental de ensayos en suelos, el cual requiere grandes superficies, maquinaria y personal especializado, sin olvidar mencionar la recolección de la llamada metadata. Esta situación hace necesaria la conformación de equipos multidisciplinarios capaces de abordar cada proyecto desde diferentes perspectivas, lo que redunda en un enriquecimiento mutuo y de los conocimientos generados. En cuanto al alcance de los estudios metagenómicos, se puede decir que pueden estudiarse ambientes prístinos o modificados por el hombre, con fines de conservación, restauración ambienta lo para evaluación de prácticas alternativas respecto de su sostenibilidad. En los ejemplos que se abordarán en esta charla, se incluye la influencia del monocultivo en la diversidad, la recuperación de la estratificación en suelos sometidos a labranza, el efecto delas rotaciones en la microbiota edáfica y de la alimentación animal, indirectamente a través de la excreta y aprovechamiento por los microorganismos del suelo, en la emisión de gases de efecto invernadero.