Mostrar el registro sencillo del ítem
dc.contributor.author
Norero, Natalia Sigrid
dc.contributor.author
Rey, María Florencia
dc.contributor.author
D'ippólito, Sebastián
dc.contributor.author
Décima Oneto, Cecilia Andrea
dc.contributor.author
Massa, Gabriela Alejandra
dc.contributor.author
Castellote, Martín Alfredo
dc.contributor.author
Feingold, Sergio Enrique
dc.contributor.author
Guevara, Maria Gabriela
dc.date.available
2023-09-01T15:28:36Z
dc.date.issued
2022-02
dc.identifier.citation
Norero, Natalia Sigrid; Rey, María Florencia; D'ippólito, Sebastián; Décima Oneto, Cecilia Andrea; Massa, Gabriela Alejandra; et al.; Genome-Wide Analyses of Aspartic Proteases on Potato Genome (Solanum tuberosum): Generating New Tools to Improve the Resistance of Plants to Abiotic Stress; MDPI; Plants; 11; 4; 2-2022; 1-21
dc.identifier.issn
2223-7747
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/210174
dc.description.abstract
Aspartic proteases are proteolytic enzymes widely distributed in living organisms and viruses. Although they have been extensively studied in many plant species, they are poorly described in potatoes. The present study aimed to identify and characterize S. tuberosum aspartic proteases. Gene structure, chromosome and protein domain organization, phylogeny, and subcellular predicted localization were analyzed and integrated with RNAseq data from different tissues, organs, and conditions focused on abiotic stress. Sixty-two aspartic protease genes were retrieved from the potato genome, distributed in 12 chromosomes. A high number of intronless genes and segmental and tandem duplications were detected. Phylogenetic analysis revealed eight StAP groups, named from StAPI to StAPVIII, that were differentiated into typical (StAPI), nucellin-like (StAPIIIa), and atypical aspartic proteases (StAPII, StAPIIIb to StAPVIII). RNAseq data analyses showed that gene expression was consistent with the presence of cis-acting regulatory elements on StAP promoter regions related to water deficit. The study presents the first identification and characterization of 62 aspartic protease genes and proteins on the potato genome and provides the baseline material for functional gene determinations and potato breeding programs, including gene editing mediated by CRISPR.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
MDPI
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
dc.subject
ABIOTIC STRESS
dc.subject
ASPARTIC PROTEASES
dc.subject
CIS-ELEMENTS
dc.subject
INTRONLESS
dc.subject
MEME
dc.subject
PHYLOGENY
dc.subject.classification
Otras Biotecnología Agropecuaria
dc.subject.classification
Biotecnología Agropecuaria
dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS
dc.title
Genome-Wide Analyses of Aspartic Proteases on Potato Genome (Solanum tuberosum): Generating New Tools to Improve the Resistance of Plants to Abiotic Stress
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2023-08-08T12:53:53Z
dc.journal.volume
11
dc.journal.number
4
dc.journal.pagination
1-21
dc.journal.pais
Suiza
dc.description.fil
Fil: Norero, Natalia Sigrid. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación Para la Producción Agropecuaria y El Desarrollo Sostenible. - Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estacion Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación Para la Producción Agropecuaria y El Desarrollo Sostenible.; Argentina
dc.description.fil
Fil: Rey, María Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; Argentina
dc.description.fil
Fil: D'ippólito, Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Décima Oneto, Cecilia Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; Argentina
dc.description.fil
Fil: Massa, Gabriela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; Argentina
dc.description.fil
Fil: Castellote, Martín Alfredo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; Argentina
dc.description.fil
Fil: Feingold, Sergio Enrique. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; Argentina
dc.description.fil
Fil: Guevara, Maria Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentina
dc.journal.title
Plants
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.3390/plants11040544
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.mdpi.com/2223-7747/11/4/544
Archivos asociados