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Artículo

Metagenome-derived draft genome sequence of acidithiobacillus ferrooxidans RV1 from an abandoned gold tailing in neuquén, Argentina

Ulloa, José Ricardo; Moya Beltrán, Ana; Issotta, Francisco; Nuñez, Harold; Covarrubias, Paulo C.; Donati, Edgardo RubenIcon ; Quatrini, Raquel; Giaveno Filippa, Maria Alejandra
Fecha de publicación: 08/2017
Editorial: Trans Tech Publications
Revista: Diffusion And Defect Data, Solid State Data. Part B, Solid State Phenomena
e-ISSN: 1662-9779
Idioma: Inglés
Tipo de recurso: Artículo publicado
Clasificación temática:
Biotecnología Medioambiental

Resumen

In this work we report the metagenome-derived draft genomic sequence of an enrichment culture dominated by A. ferrooxidans obtained from an airlift bioreactor inoculated with the microbial consortium recovered from the “Relave Viejo” tailing. The genome of this culture was assembled de-novo and by reference, generating a consensus assembly of 3.0 Mb. On the basis of 16S rRNA (100 % identity), average nucleotide identity analysis (99.33% identity) and in silico DNA-DNA hybridization against A. ferrooxidans ATCC 23270T (97.9%), the recovered genome is confirmed to pertain to A. ferrooxidans species. Comparative genomics results are presented to uncover the genetic traits of the variant surviving lime treatment and to further explore the genomic diversity of these model iron oxidizing species.
Palabras clave: ABANDONED TAILING , ACIDITHIOBACILLUS FERROOXIDANS RV1 , GOLD MINE , LIME TREATMENT , NORTHERN PATAGAONIA
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info:eu-repo/semantics/openAccess Excepto donde se diga explícitamente, este item se publica bajo la siguiente descripción: Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 2.5 Unported (CC BY-NC-SA 2.5)
Identificadores
URI: http://hdl.handle.net/11336/180906
DOI: http://dx.doi.org/10.4028/www.scientific.net/SSP.262.439
URL: https://www.scientific.net/SSP.262.439
Colecciones
Articulos(CINDEFI)
Articulos de CENT.DE INV EN FERMENTACIONES INDUSTRIALES (I)
Articulos(PROBIEN)
Articulos de INST. DE INVESTIGACION Y DES. EN ING. DE PROCESOS, BIOTECNOLOGIA Y ENERGIAS ALTERNATIVAS
Citación
Ulloa, José Ricardo; Moya Beltrán, Ana; Issotta, Francisco; Nuñez, Harold; Covarrubias, Paulo C.; et al.; Metagenome-derived draft genome sequence of acidithiobacillus ferrooxidans RV1 from an abandoned gold tailing in neuquén, Argentina; Trans Tech Publications; Diffusion And Defect Data, Solid State Data. Part B, Solid State Phenomena; 262 SSP; 8-2017; 439-442
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